高通量测序法研究不同pH的饮用水对SPF小鼠肠道微生物的影响
本文选题：肠道微生物 切入点：S 出处：《中国比较医学杂志》2017年07期 论文类型：期刊论文
【摘要】：目的研究不同pH饮用水对SPF小鼠肠道微生物多样性的影响。方法 21日龄SPF小鼠90只随机分成3组,每组30只,分别给予三类水,即酸化水(pH 3.0),中性水(pH 7.0)和碱性水(pH 9.0),并进行为期三个月的饲养。每组分别在饲养4周、8周、12周末各处死10只动物,取血清按SPF国标项目检测了细菌、病毒、寄生虫,取回盲部内容物,根据细菌16S rRNA的保守性设计引物,构建文库,进行高通量(Illumina)测序,获得10 G的数据,并对数据进行统计,聚类分析。结果以pH 3.0处理的小鼠肠道微生物丰富度适中,稳定性高。结论在规模化饲养条件下,选取pH 3.0饮用水小鼠能较长时间维持肠道微生物多样性,稳定性达到一个平台。本研究为长期稳定维持动物质量的生产实践提供了理论与技术支持,也是胃肠道宏基因组学技术在动物质量控制领域的一个具体应用。
[Abstract]:Objective to study the effects of drinking water with different pH on intestinal microbial diversity in SPF mice. Methods 90 SPF mice aged 21 days were randomly divided into 3 groups, 30 in each group and given three kinds of water, respectively. The pH value of acidified water (pH 3.0), neutral water (pH 7.0) and alkaline water (pH 9.0) were fed for three months. 10 animals were killed in each group for 4 weeks, 8 weeks and 12 weeks, respectively. The serum samples were collected for the detection of bacteria, viruses and parasites according to the SPF national standard. According to the conservative primer design of 16s rRNA, the library was constructed, and the high throughput Illumina) sequencing was carried out. The data of 10G were obtained, and the data were counted. Results the intestinal microorganism richness of mice treated with pH 3.0 was moderate and the stability was high. Conclusion under the condition of large-scale feeding, pH 3.0 drinking water mice can maintain the diversity of intestinal microbes for a long time. This study provides theoretical and technical support for the long-term and stable maintenance of animal quality, and is also a concrete application of gastrointestinal macrogenomics in animal quality control.
【作者单位】： 浙江大学动物科学学院;浙江省医学科学院;
【基金】：浙江省公益技术应用研究计划(2011C37096,2015C37102) 浙江省医药卫生平台骨干人才基金(2015RCA006) 浙江省自然科学基金(LY16H030011)
【分类号】：R-33
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，本文编号：1582311
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