湖南汉族人群16个Y-STR基因座遗传多态性研究

发布时间：2018-03-13 11:12

  本文选题：法医物证学　切入点：Y染色体短串联重复序列(Y-STR)　出处：《中南大学》2012年硕士论文　论文类型：学位论文

【摘要】：目的： 通过对湖南汉族人群16个Y-STR基因座进行检测,分析16个Y-STR基因座在湖南汉族人群中的基因频率分布和相关遗传学参数,以及16个Y-STR组成的单倍型进行调查分析,为本地区人群亲缘关系鉴定和个体识别提供数据积累,促进湖南地区汉族人群Y-STR数据库的建立；丰富中国汉族群体遗传学数据资料,为其他地区的法医学鉴定提供参考数据；为人类遗传学研究和其它相关研究提供数据参考。 方法： 1.研究样本的选择：2008年至2009年10月间亲缘关系鉴定案例中,出生于湖南省的汉族健康男性174人,经询问追溯其三代以内均居住于湖南地区,在征得其同意后,采集指血于滤纸上风干保存备用。 2.基因组DNA的提取：Chelex-100加蛋白酶K方法提取基因组DNA； 3.PCR扩增：GeneAmp PCR System9700(Applied Biosystems) PCR仪、ABI AmpF Y-filerTM试剂盒扩增Y染色体16个Y-STR基因座(DYS456、DYS389Ⅰ、DYS389Ⅱ、DYS390、DYS458、DYS19、DYS385、 DYS393、DYS391、DYS439、DYS635、DYS392、Y-GATA-H4、DYS437、 DYS438、DYS448); 4.电泳分离及基因分型：ABI-3130型DNA遗传分析仪电泳分离和激光扫描分析；GeneMapper(?) ID Software v3.2软件进行基因分型。等位基因分型以试剂盒内等位基因分型标准物为标准。 5.数据统计及分析：Excel软件进行Y-STR单倍型数据统计；基因多样性(gene diversity, GD)采用公式GD=n(1-∑Pi2)/(n-1)(Pi为等位基因或单倍型频率,n为样本数)计算；用ARLEQUIN3.1软件进行人群间比较；用MEGA4软件构建遗传进化树。 结果： 1.16个基因座基因频率分布在0.0143-0.7143之间,GD值在0.4476(DYS438)-0.8365(DYS385)之间,累积GD值为0.9992,多态性高。 2. ARIQUIN3.1软件分析进行人群间比较结果,与台湾汉族、浙江汉族人群无显著差异(P0.05),与山东汉族、宁夏回族、日本、韩国、青海藏族、拉萨市藏族,中国藏族、中国萨拉族、西伯利亚人群均有显著差异(P0.05)；湖南汉族人群Y-STR数据有其独特性。对于湖南汉族人群法医学鉴定有极高的应用有价值。 3.用MEGA4.0分析软件中UPGMA方法构建的遗传进化树显示,湖南汉族、台湾、浙江汉族、山东汉族聚为一群,宁夏回族、青海萨拉族人群聚为一簇,日本和韩国人群聚为一簇,不同地区的四个藏族人群聚为一簇,与其地理分布一致。提示Y染色体STR对于人类进化和迁移历史的研究有重要意义。 结论： 湖南汉族人群16个Y-STR基因座多态性高,适合应用于湖南汉族人群亲缘关系鉴定和个体识别,对促进湖南地区汉族人群Y-STR数据库的建立具有重大意义。为其他地区的法医学鉴定及人群数据库的建立提供数据参考。
[Abstract]:Objective:. By detecting 16 Y-STR loci in Hunan Han population, the frequency distribution and genetic parameters of 16 Y-STR loci in Hunan Han population were analyzed, and the haplotypes of 16 Y-STR loci were investigated. To provide data accumulation for genetic identification and individual identification, to promote the establishment of Y-STR database of Han population in Hunan, to enrich genetic data of Han population in China, and to provide reference data for forensic identification in other regions. To provide data reference for human genetics and other related research. Methods:. 1. Selection of the study sample: 174 healthy Han males born in Hunan Province were selected from 2008 to October 2009, who lived in Hunan Province within three generations, and obtained their consent. Collect blood and dry it on filter paper. 2.Genomic DNA extraction by Chelex-100 plus protease K method; 3.GeneAmp PCR System9700(Applied Biosystemes) ABI AmpF Y-filerTM kit was used to amplify 16 Y-STR loci of Y chromosome DYS456DYS389 鈪，

本文编号：1606128