山东烟台地区HCV基因分型研究

发布时间：2019-09-20 02:03

【摘要】：目的了解山东烟台地区丙型肝炎病毒的基因分型,结合受试者的肝功能指标观察基因型别与肝损情况是否相关。 方法采用特异性PCR引物对HCV RNA5'UTR区和/或NS5B区进行扩增,PCR产物进行序列分析,通过与GenBank中参考序列的比对,联合遗传进化树对标本予以分型。 结果22份HCV RNA阳性无偿献血员标本有9例可明确分型,可分型率为40.9%;48例HCV RNA阳性丙型肝炎患者标本,有33例可明确分型,可分型率为68.8%。9例无偿献血员中检出1b和3a两种基因亚型,分别为8例(88.9%)和1例(11.1%)；33例丙肝患者中,检出1b、2a和6a三种基因亚型,分别为22(66.7%)、10(30.3%)和1(3.03%)例。1b亚型是烟台地区HCV携带者的优势流行基因亚型,在不同人群中分布差异无显著性(χ2=0.796,P=0.373)；不同基因分型的受试者其肝损指标的差异有显著性(P0.05),2a型携带者的ALT、AST均值明显高于1b型。 结论山东烟台地区HCV基因型呈现多样性,以1b型为主,并首次检出3a和6a亚型；人群存在HCV潜伏感染,应加强献血员HCV感染的检测,确保临床输血安全：HCV基因型与肝损指标具有相关性,2a型HCV感染可能在肝细胞的病变过程中起着重要作用。
【图文】：

有3例标本扩增的是NSSB基因，由于例数较少，仅通过序列的同源性比对确定基因分型。根据测序结果绘制本地区其余39例标本5’UTR区的遗传进化树，见图1。从该图可以看出，，遗传进化树所得基因型结果与同源性分析结果较一致。 HCV3a型 4312号样木与瑞典的HCVS’ UTR3a株(GenBank号为AJ621215)分型结果一致;HCV6a型4361号样本与越南北部的HCVS’ UTR6a株(GenBank号为D88469)分型结果一致。本地区大部分1b型HCV分离毒株进化较保守，与lb型HCV中国株(GenBank号为D10934)和lb型HCV日本株(GenBank号为AB442220)分型一致。而本地区2a型HCv分离株的变异则稍显活跃，个别样本与2a型HCV日本株的遗传进化距离增加，提示可能为2型的其它亚型。8
【学位授予单位】：青岛大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2011
【分类号】：R373

【参考文献】

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本文编号：2538480