感染后白细胞降低患者的关键甲基化基因的筛选

发布时间：2020-04-14 16:14

【摘要】：目的:探讨感染伴白细胞降低的相关病理生理学机制,为基因诊断及治疗提供新思路。方法:选取2017年1月至2017年12月我院确诊为感染伴白细胞降低的患者为病例组,感染后白细胞升高的患者为阴性对照组,同期我院健康体检者30例为正常对照组,首先对患者的临床资料进行分析,再进行全基因组甲基化检测,从中选出关键甲基化位点后进行后续的验证试验。结果:血清补体C3、C5在白细胞降低组较白细胞升高组和正常对照组均降低,进行了全基因组甲基化检测,我们分析得出差异甲基化位点的数目、差异甲基化基因数目、差异甲基化位点的位置,再通过富集分析,得出统计上显著富集的通路、疾病功能等,最终我们得出基因NOX5、WWP2、AKT2、CBARA1可能与感染伴白细胞降低发病有关,验证试验后得出WWP2基因、AKT2基因、CBARA1基因甲基化与感染致白细胞降低有关,其中尤其是WWP2基因与感染致白细胞降低有密切相关性。结论:趋化因子分泌异常、细胞迁移障碍、泛素化修饰障碍、氧化应激降低可能是白细胞降低伴感染的发病机制。
【图文】：

2.1.1 对差异甲基化位点数目进行统计分析2.1.1.1 白细胞降低组vs白细胞升高组 共检测到24230个差异甲基化位点，对其进行聚类分析,如图1；其中甲基化水平增高与同一位点上既有升高又有降低的位点共

UP、Down、Disaccord 分别代表基因的甲基化水平升高、降低、同一基因上既有升高又有降低的CpG位点；HyperMethylation=UP+DisaccordHypoMethylation=Down+Disaccord，具体见图2。以上位点对应10186个基因（表略），，其中甲基化水平增高与同一基因上既有升高又有降低的基因共有7334个，甲基化水平降低与同一基因上既有升高又有降低的基因共有5013个。见图3。图 1 白细胞降低组 vs 白细胞升高组聚类分析Fig.1 Cluster analysis of leukocyte-lowering group and leukocyte-raising group图 2 细胞降低组 vs 白细胞升高差异甲基化位点Fig.2 WBC decrease group vs. WBC elevation differential methylation site
【学位授予单位】：新疆医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：R392

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本文编号：2627475