加味脑泰方对血管性痴呆模型大鼠海马组织mRNA表达谱的微阵列分析
发布时间：2020-12-07 14:31
目的采用微阵列技术分析加味脑泰方干预前后血管性痴呆（VD）模型大鼠海马组织m RNA表达谱,以探究其治疗VD的分子机制。方法采用双侧颈总动脉结扎术制作VD大鼠模型,给予加味脑泰方治疗30 d,HE染色和水迷宫实验评价治疗效果,Agilent mRNA表达谱芯片获取加味脑泰方干预前后VD模型大鼠海马组织m RNA表达数据,微阵列分析筛选显著差异表达的基因,构建蛋白与蛋白相互作用（PPI）网络,GO和Pathway富集分析差异基因主要参与的生物学过程和信号通路,利用免疫组化和实时荧光定量PCR（qRT-PCR）验证芯片分析结果。结果 HE染色和水迷宫实验显示VD大鼠呈现脑缺血、海马神经细胞损伤、空间学习记忆能力下降,加味脑泰方可以部分逆转该现象。微阵列技术分析筛选出加味脑泰方干预前后差异表达的基因469个,其中上调180个,下调289个,IL6、FGF2、TNF、IL1b等可能是其治疗VD的主要药效靶点,免疫组化和qRT-PCR验证了该分析结果。GO和Pathway富集分析显示,这些基因与炎症反应、凋亡过程等生物学过程密切相关,主要参与了TNF信号通路、Toll样受体信号通路、细胞凋亡途径...
【文章来源】：中草药. 2019年24期 第6064-6072页 北大核心
【文章页数】：9 页
【部分图文】：
加味脑泰方对VD大鼠学习和记忆能力的影响
差异表达基因的PPI网络构建及功能分析
差异表达基因的PPI网络构建及功能分析结果见图3。将469个差异表达的基因导入到STRING数据库获取这些基因的PPI网络（图3-A），排除部分非编码基因和lncRNA等未获得蛋白相互作用信息外，共有174个基因编码的蛋白之间存在351种相互作用关系。网络中根据每个蛋白相互作用关系的多少来确定节点的大小和颜色深度，其中处于网络中心拥有最多相互作用的蛋白为Il6(degree=32），其次为Fgf2(degree=17）和Tnf(degree=17）、Il1b(degree=15）。对PPI网络中的基因进行GO和通路富集分析描述这些基因在疾病发生发展中参与的生物学过程。GO富集结果表明加味脑泰方干预后主要影响了急性炎症反应、衰老、JUN激酶活性的正调控、凋亡过程、血管生成、缺氧反应、细胞对神经生长因子刺激的反应等生物学过程（图3-C），通路富集分析显示这些基因主要参与了TNF信号通路、Toll样受体信号通路、c GMP-PKG信号通路、细胞凋亡途径、PI3K-Akt信号通路和MAPK信号通路（图3-D）。同时利用STRING数据库的kmeans＿clusters功能对网络进行拓扑模块（Cluster）分析，获得2个重要的拓扑模块（图3-B）。其中Cluster1处于PPI网络中心，可能是加味脑泰方治疗VD大鼠的重要药效途径，主要与凋亡途径、调节炎症和免疫信号通路（NOD-like receptor signaling pathway、Toll-like receptor signaling pathway、TNF signaling pathway）密切相关，而Cluster2主要与核糖体、核蛋白体转运及细胞对神经生长因子刺激的反应有关。图3 差异表达基因的PPI网络构建及功能分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]中药复方防治血管性痴呆的实验研究进展[J]. 杨梦琳,张运辉,伍大华. 中医药信息. 2019(04)
[2]基于SIRT1/NF-κB炎性通路探讨加味脑泰方对血管性痴呆大鼠学习记忆及海马组织病理形态的影响[J]. 易亚乔,何清湖,刘检,刘林,成绍武,廖君,王国佐,谭琥,刘吉勇,陈俊炜,郭艳幸,葛金文. 湖南中医药大学学报. 2019(06)
[3]血管性痴呆中医治疗研究进展[J]. 徐再宁,谭文澜,刘凯模,梁彦启. 实用中医药杂志. 2019(06)
[4]Bioinformatics analyses of differentially expressed genes associated with spinal cord injury:a microarray-based analysis in a mouse model[J]. Lei Guo,Jing Lv,Yun-Fei Huang,Ding-Jun Hao,Ji-Jun Liu. Neural Regeneration Research. 2019(07)
[5]细叶远志皂苷调控胆碱能神经环路改善血管性痴呆小鼠认知功能障碍的研究[J]. 吴桓宇,蒋辉,姜亚军. 临床和实验医学杂志. 2018(16)
[6]中医药治疗血管性痴呆研究概况[J]. 李强,耿秀超,聂金涛,于文涛. 中医临床研究. 2018(12)
[7]从中医五脏论血管性痴呆的病机[J]. 郭清,宫洪涛. 中国中医药现代远程教育. 2018(01)
[8]内质网应激PERK通路在脑泰方提取物保护局灶性脑缺血大鼠海马神经元中的作用[J]. 石咏梅,马英民,廖君,易亚乔,余清平,黄娟,葛金文. 中国老年学杂志. 2017(22)
[9]中药脑泰方对大鼠脑缺血后VEGF和Angiopoietins表达的实验研究[J]. 宋祯彦,周瑜,王珊珊,龚胜强,刘晓丹,李平,王国佐. 湖南中医药大学学报. 2016(01)
[10]三七制剂对血管性痴呆大鼠海马区COX-2表达的影响[J]. 杨同,刘志辉,王欣,徐萍萍,孙文卿. 潍坊医学院学报. 2015(03)
博士论文
[1]血管性痴呆中医理论探讨及益气活血祛痰法防治作用研究[D]. 易亚乔.湖南中医药大学 2017
硕士论文
[1]脑泰方汤剂和胶囊剂中化学成分的定量研究[D]. 陈镇.湖南中医药大学 2005
本文编号：2903424
【文章来源】：中草药. 2019年24期 第6064-6072页 北大核心
【文章页数】：9 页
【部分图文】：
加味脑泰方对VD大鼠学习和记忆能力的影响
差异表达基因的PPI网络构建及功能分析
差异表达基因的PPI网络构建及功能分析结果见图3。将469个差异表达的基因导入到STRING数据库获取这些基因的PPI网络（图3-A），排除部分非编码基因和lncRNA等未获得蛋白相互作用信息外，共有174个基因编码的蛋白之间存在351种相互作用关系。网络中根据每个蛋白相互作用关系的多少来确定节点的大小和颜色深度，其中处于网络中心拥有最多相互作用的蛋白为Il6(degree=32），其次为Fgf2(degree=17）和Tnf(degree=17）、Il1b(degree=15）。对PPI网络中的基因进行GO和通路富集分析描述这些基因在疾病发生发展中参与的生物学过程。GO富集结果表明加味脑泰方干预后主要影响了急性炎症反应、衰老、JUN激酶活性的正调控、凋亡过程、血管生成、缺氧反应、细胞对神经生长因子刺激的反应等生物学过程（图3-C），通路富集分析显示这些基因主要参与了TNF信号通路、Toll样受体信号通路、c GMP-PKG信号通路、细胞凋亡途径、PI3K-Akt信号通路和MAPK信号通路（图3-D）。同时利用STRING数据库的kmeans＿clusters功能对网络进行拓扑模块（Cluster）分析，获得2个重要的拓扑模块（图3-B）。其中Cluster1处于PPI网络中心，可能是加味脑泰方治疗VD大鼠的重要药效途径，主要与凋亡途径、调节炎症和免疫信号通路（NOD-like receptor signaling pathway、Toll-like receptor signaling pathway、TNF signaling pathway）密切相关，而Cluster2主要与核糖体、核蛋白体转运及细胞对神经生长因子刺激的反应有关。图3 差异表达基因的PPI网络构建及功能分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]中药复方防治血管性痴呆的实验研究进展[J]. 杨梦琳,张运辉,伍大华. 中医药信息. 2019(04)
[2]基于SIRT1/NF-κB炎性通路探讨加味脑泰方对血管性痴呆大鼠学习记忆及海马组织病理形态的影响[J]. 易亚乔,何清湖,刘检,刘林,成绍武,廖君,王国佐,谭琥,刘吉勇,陈俊炜,郭艳幸,葛金文. 湖南中医药大学学报. 2019(06)
[3]血管性痴呆中医治疗研究进展[J]. 徐再宁,谭文澜,刘凯模,梁彦启. 实用中医药杂志. 2019(06)
[4]Bioinformatics analyses of differentially expressed genes associated with spinal cord injury:a microarray-based analysis in a mouse model[J]. Lei Guo,Jing Lv,Yun-Fei Huang,Ding-Jun Hao,Ji-Jun Liu. Neural Regeneration Research. 2019(07)
[5]细叶远志皂苷调控胆碱能神经环路改善血管性痴呆小鼠认知功能障碍的研究[J]. 吴桓宇,蒋辉,姜亚军. 临床和实验医学杂志. 2018(16)
[6]中医药治疗血管性痴呆研究概况[J]. 李强,耿秀超,聂金涛,于文涛. 中医临床研究. 2018(12)
[7]从中医五脏论血管性痴呆的病机[J]. 郭清,宫洪涛. 中国中医药现代远程教育. 2018(01)
[8]内质网应激PERK通路在脑泰方提取物保护局灶性脑缺血大鼠海马神经元中的作用[J]. 石咏梅,马英民,廖君,易亚乔,余清平,黄娟,葛金文. 中国老年学杂志. 2017(22)
[9]中药脑泰方对大鼠脑缺血后VEGF和Angiopoietins表达的实验研究[J]. 宋祯彦,周瑜,王珊珊,龚胜强,刘晓丹,李平,王国佐. 湖南中医药大学学报. 2016(01)
[10]三七制剂对血管性痴呆大鼠海马区COX-2表达的影响[J]. 杨同,刘志辉,王欣,徐萍萍,孙文卿. 潍坊医学院学报. 2015(03)
博士论文
[1]血管性痴呆中医理论探讨及益气活血祛痰法防治作用研究[D]. 易亚乔.湖南中医药大学 2017
硕士论文
[1]脑泰方汤剂和胶囊剂中化学成分的定量研究[D]. 陈镇.湖南中医药大学 2005
本文编号：2903424
本文链接：https://www.wllwen.com/xiyixuelunwen/2903424.html
