基于核糖体DNA第二内转录间隔区基因的9种蚊虫分子鉴定

发布时间：2020-12-09 12:51

　　目的分析常见9种蚊虫核糖体DNA第二内转录间隔区（rDNA-ITS2）基因序列特征,为蚊虫种类分子鉴定方法探讨提供依据。方法在山东省济宁市采集淡色库蚊、三带喙库蚊、二带喙库蚊、白纹伊蚊、刺扰伊蚊、中华按蚊、骚扰阿蚊、常型曼蚊和黄色柯蚊成蚊,形态学种类鉴定后,提取上述9种蚊虫DNA,PCR扩增rDNA-ITS2基因并测序;在GenBank中进行同源性比对,采用Bioedit 7.0软件及DNAMAN软件对测序结果进行比对分析,通过DNASTAR、ClustalX 1.81和Mega6软件分析列特征并构建系统进化树探讨系统发生关系。结果 9种蚊虫的rDNAITS2长度在343 bp与577 bp之间,共有59个保守位点、449个变异位点、235个简约信息位点和191个单态位点,9种蚊虫种间序列同源性为28.21%～53.76%;所有蚊虫的rDNA-ITS2基因分子鉴定与形态学鉴定吻合率100%,库蚊属的淡色库蚊、三带喙库蚊和二带喙库蚊聚成一类,伊纹属的白纹伊蚊和刺扰伊蚊聚成一类,不同种蚊虫为独立分支。结论核糖体DNA第二内转录间隔（rDNA-ITS2）基因可用于蚊虫属和种的鉴定。 

【文章来源】：热带病与寄生虫学. 2020年01期 第12-16页

【文章页数】：5 页

【部分图文】：

9种蚊种的r DNA-ITS2基因PCR产物电泳结果

采用NJ法和UPGMA法构建系统进化树，所有系统数树支上数值为1 000次Bootstrap检测得到的对该支的支持百分数。从图中可以看出这两种不同的分子系统树具有大致相同的拓扑结构，库蚊属的淡色库蚊、三带喙库蚊和二带喙库蚊聚成一类，伊纹属的白纹伊蚊和刺扰伊蚊聚成一类，但这两个系统中，骚扰阿蚊、黄色柯蚊、常型曼蚊和中华按蚊的位置有所不同。在NJ树中，该四种蚊虫为独立分支，而UPGMA树中，骚扰阿蚊和黄色柯蚊聚为一类(图2)。讨论

【参考文献】：
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本文编号：2906889