布鲁氏菌Omp10蛋白抗原表位的生物信息学分析
发布时间:2020-12-21 19:24
目的用生物信息学技术预测布鲁氏菌Omp10蛋白的抗原表位,寻找布鲁氏菌Omp10的优势表位。方法利用IEDB在线软件、DNAStar软件、Pro Pred MHC Class-ⅡBinding Peptide Prediction Server软件和SYFPEITHI软件,通过分子结构、亲水性、柔韧性、表面可及性以及抗原指数等在线分析Omp10蛋白的二级结构、B细胞抗原表位及T细胞抗原表位。结果布鲁氏菌Omp10蛋白B细胞抗原表位有4个,为26-34、65-75、97-102和115-120氨基酸残基。Omp10蛋白T细胞抗原表位有6个,为64-79、72-87、104-119、6-21、9-24和78-93氨基酸残基。结论通过综合分析布鲁氏菌Omp10蛋白有4个B细胞抗原表位和6个T细胞抗原表位,为进一步筛选具有一定抗原保护性和免疫原性的优势表位和多价疫苗构建奠定了基础。
【文章来源】:新疆医科大学学报. 2016年10期
【文章页数】:6 页
【部分图文】:
线性表位预测
β转角预测
表面可及性预测
【参考文献】:
期刊论文
[1]用DNAStar软件预测Rv1410c结核分枝杆菌蛋白抗原表位[J]. 李江英,白雪娟,梁艳,张俊仙,阳幼荣,赵卫国,吴雪琼. 细胞与分子免疫学杂志. 2015(04)
[2]细粒棘球绦虫AgB1抗原表位的生物信息学预测[J]. 马秀敏,胡晓安,阿尔孜古丽·吐尔逊,李艳华,刘学磊,朱明,丁剑冰. 科技导报. 2013(27)
[3]布鲁氏菌的致病机制与细胞免疫机制研究进展[J]. 董炳梅,王金良,唐娜,苗立中,沈志强. 中国人兽共患病学报. 2012(06)
本文编号:2930362
【文章来源】:新疆医科大学学报. 2016年10期
【文章页数】:6 页
【部分图文】:
线性表位预测
β转角预测
表面可及性预测
【参考文献】:
期刊论文
[1]用DNAStar软件预测Rv1410c结核分枝杆菌蛋白抗原表位[J]. 李江英,白雪娟,梁艳,张俊仙,阳幼荣,赵卫国,吴雪琼. 细胞与分子免疫学杂志. 2015(04)
[2]细粒棘球绦虫AgB1抗原表位的生物信息学预测[J]. 马秀敏,胡晓安,阿尔孜古丽·吐尔逊,李艳华,刘学磊,朱明,丁剑冰. 科技导报. 2013(27)
[3]布鲁氏菌的致病机制与细胞免疫机制研究进展[J]. 董炳梅,王金良,唐娜,苗立中,沈志强. 中国人兽共患病学报. 2012(06)
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