蜱源LCMV的鉴定和全基因组序列分析
发布时间：2021-01-10 05:13
蜱是非常重要的媒介节肢动物,其种类丰富、分布广泛,可传播多种人畜共患疾病,危害极大。我国东北地区常见蜱传病包括莱姆病、巴贝斯虫病、立克次体斑点热、森林脑炎、发热伴血小板综合征等。大多数蜱媒传染病临床症状不典型,在临床上易被误诊和漏诊。蜱传病现已成为传染病科研热点之一。随着分子生物学技术的不断进步和统计方法的不断完善,蜱传病原的鉴别与临床诊断水平获得了长足的提升。淋巴细胞脉络丛脑膜炎病毒（lymphocytic choriomeningitis virus,LCMV）,属于单股负链RNA病毒目,沙粒病毒科,沙粒病毒属病毒,也是沙粒病毒科最早被发现的病毒。其自然宿主为啮齿类动物,疾病感染途径包括与啮齿类动物接触,被啮齿类动物叮咬和被携带病毒的节肢类动物叮咬。LCMV感染人后可引发无症状的持续性感染,严重的会引发脑膜炎致死,免疫力缺陷病人感染该病毒后致死率更高。20世纪70年代,曾有报道65名病人感染慢性淋巴细胞脑膜炎,原因疑似为蜱叮咬传播。近50年来无蜱携带LCMV报道。本研究于2015年4月在吉林省敦化市和珲春市敬信镇采集蜱样品,将采集蜱样品依据蜱种和地区分组,进行宏病毒基因组测序,发现...
【文章来源】：吉林农业大学吉林省
【文章页数】：66 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
四种蜱A:草原革蜱背部，a:草原革蜱腹部;B:全沟硬蜱，b:全沟硬蜱;C:森林革蜱，c:森林革蜱;D:长角血蜱背
蜱 2：草原革蜱 3：森林革蜱 4：嗜群血蜱 5:草原革蜱 6:DNA 分子质量标7:阴性对照es persulcatus 2: Dermacentor nuttalli 3: Dermacentor silvarum 4: Haelongicornis 5: Dermacentor nuttalli 6:Marker2000 7: Negative co敦化市和珲春市敬信镇共采集蜱样本 534 只，敦化市采集 147 只，草原革蜱 230 只（43%），森林革蜱 205 只（38.3%），长角血蜱 61 只（（7.1%），草原革蜱和森林革蜱为两地优势蜱种，而全沟硬蜱在两分布见表 1.4。表 1.4.吉林省敦化市和敬信镇蜱种分布1.4 Species and location information of Jilin Province tick samplTick speciescNo. of ticksDunHua JingXinNo.of ticksNo. of ticks
图 1.3.不同蜱样本中检测 LCMV5 泳道为阴性对照，1-12 泳道为不同蜱种蜱样本，M:Maeker2000 DNA 分子质量检测标尺。Fig.1.3 Different samples test Lymphocytic choriomeningitis virus5:Negative control；1 -12 test samples；M：DNA Marker 2000； 组为 4 号样本（敬信草原革蜱），3 组为 14 号样本（敬信森林革蜱），9 组为 31 号敬信长角血蜱），12 组为 46 号样本（敦化全沟硬蜱），共有四种蜱携带 LCMV。CMV 序列分析用软件 DNAStar 对序列进行对比。对四中蜱携带的 LCMV 一致性较高为 98%。在 中进行 Nucleotide Blast 同源性比对结果显示:与数据库中 LCMV 序列同源性为 88%～与 DQ868484.1 同源性最高，为 88%。发现吉林省敦化市和珲春市敬信镇四个蜱种之间CMV 差异不大，而与已发现的 LCMV 毒株有较大差异。吉林省蜱 LCMV 阳性率统计
本文编号：2968128
【文章来源】：吉林农业大学吉林省
【文章页数】：66 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
四种蜱A:草原革蜱背部，a:草原革蜱腹部;B:全沟硬蜱，b:全沟硬蜱;C:森林革蜱，c:森林革蜱;D:长角血蜱背
蜱 2：草原革蜱 3：森林革蜱 4：嗜群血蜱 5:草原革蜱 6:DNA 分子质量标7:阴性对照es persulcatus 2: Dermacentor nuttalli 3: Dermacentor silvarum 4: Haelongicornis 5: Dermacentor nuttalli 6:Marker2000 7: Negative co敦化市和珲春市敬信镇共采集蜱样本 534 只，敦化市采集 147 只，草原革蜱 230 只（43%），森林革蜱 205 只（38.3%），长角血蜱 61 只（（7.1%），草原革蜱和森林革蜱为两地优势蜱种，而全沟硬蜱在两分布见表 1.4。表 1.4.吉林省敦化市和敬信镇蜱种分布1.4 Species and location information of Jilin Province tick samplTick speciescNo. of ticksDunHua JingXinNo.of ticksNo. of ticks
图 1.3.不同蜱样本中检测 LCMV5 泳道为阴性对照，1-12 泳道为不同蜱种蜱样本，M:Maeker2000 DNA 分子质量检测标尺。Fig.1.3 Different samples test Lymphocytic choriomeningitis virus5:Negative control；1 -12 test samples；M：DNA Marker 2000； 组为 4 号样本（敬信草原革蜱），3 组为 14 号样本（敬信森林革蜱），9 组为 31 号敬信长角血蜱），12 组为 46 号样本（敦化全沟硬蜱），共有四种蜱携带 LCMV。CMV 序列分析用软件 DNAStar 对序列进行对比。对四中蜱携带的 LCMV 一致性较高为 98%。在 中进行 Nucleotide Blast 同源性比对结果显示:与数据库中 LCMV 序列同源性为 88%～与 DQ868484.1 同源性最高，为 88%。发现吉林省敦化市和珲春市敬信镇四个蜱种之间CMV 差异不大，而与已发现的 LCMV 毒株有较大差异。吉林省蜱 LCMV 阳性率统计
本文编号：2968128
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