脑膜炎奈瑟球菌外膜蛋白NMB0315的晶体结构研究
发布时间:2021-02-20 09:30
脑膜炎奈瑟球菌是一种时常附着在人类鼻咽部的共生菌,同时也是引起脑膜炎的主要原因。全球性脑膜炎的爆发非常危险,在一些国家中,死亡率有时会达到10%。由于脑膜炎病情发展迅速,提前的预防治疗变得非常重要,这使得研究者将大量精力放在脑膜炎疫苗的开发上。脑膜炎奈瑟球菌的外膜蛋白常与细菌毒性相关,由于其时常暴露于细胞外膜上,也使之成为脑膜炎疫苗研发的潜在依据。为此,一大批脑膜炎球菌的外膜蛋白被发现和研究,其中就包括了NMB0315蛋白。NMB0315是一种B群脑膜炎球菌的外膜蛋白,尽管关于其功能的研究较少,但是通过序列的相似性比较,发现它是一种lysostaphin类肽酶,属于M23金属肽酶超家族。这个家族的蛋白成员被认为是锌离子依赖的肽酶,具有水解富含甘氨酸的多肽的功能。它们常存在于各种革兰氏阳性及阴性细菌中,依靠其肽酶的活性,参与到细胞生长、分裂以及一些细菌毒性相关的生理活动中。到目前为止,通过晶体学的手段,研究者们已经获得了一些lysostaphin类蛋白的三维结构。尽管它们在锌离子结合的活性位点上相对保守,但是其整体结构上的差异,还是让人们对于它们在不同细菌中的功能意义产生疑问。同时,一些...
【文章来源】:南开大学天津市 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:138 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
脑膜炎球菌外膜结构及外膜蛋白
的loop区域恰好嵌合入目标分子的底物结合“沟”;而这个嵌入的部分包含了三个连续的甘氨酸,与催化核心的锌离子临近(如图1.9)。这个“巧合”也许正是模拟了底物进入酶活中心的方式,为研究lysostaphin类肽酶与底物相互作用提供了一定结构上的帮助。图1.9两种晶型中的甘氨酸loop嵌入底物结合“沟”LytM并不是唯一在晶体结构中被观察到的处于非活性状态的lysostaphin肽酶,另外一个例子是霍乱弧菌CVibfio cho丨era)中的lysostaphin蛋白(P01) [73]。P01在晶体结构中包含有三个独立的结构域,其中第三个结构域为催化结构域,在结构上非常保守,对应于其它lysostaphin的活性结构域(如处于激活态的LytM片段),如图1.10。含有锌离子的催化核心与LytM高度一致,但是对应于全长LytM中N117的位置被一个水分子所取代?
出具有相同相位、频率和波长的次生电磁波,即发生衍射。由于晶体中的原具有高度的有序性,当衍射角、X射线波长与原子间距离满足布拉格定律时,原子的衍射光会发生干涉而加强,从而形成特殊的衍射图样。通过收集衍射样中各衍射点的位置和强度,能够最终分析得出晶体中蛋白质分子的结构(如 2.4)。
本文编号:3042575
【文章来源】:南开大学天津市 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:138 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
脑膜炎球菌外膜结构及外膜蛋白
的loop区域恰好嵌合入目标分子的底物结合“沟”;而这个嵌入的部分包含了三个连续的甘氨酸,与催化核心的锌离子临近(如图1.9)。这个“巧合”也许正是模拟了底物进入酶活中心的方式,为研究lysostaphin类肽酶与底物相互作用提供了一定结构上的帮助。图1.9两种晶型中的甘氨酸loop嵌入底物结合“沟”LytM并不是唯一在晶体结构中被观察到的处于非活性状态的lysostaphin肽酶,另外一个例子是霍乱弧菌CVibfio cho丨era)中的lysostaphin蛋白(P01) [73]。P01在晶体结构中包含有三个独立的结构域,其中第三个结构域为催化结构域,在结构上非常保守,对应于其它lysostaphin的活性结构域(如处于激活态的LytM片段),如图1.10。含有锌离子的催化核心与LytM高度一致,但是对应于全长LytM中N117的位置被一个水分子所取代?
出具有相同相位、频率和波长的次生电磁波,即发生衍射。由于晶体中的原具有高度的有序性,当衍射角、X射线波长与原子间距离满足布拉格定律时,原子的衍射光会发生干涉而加强,从而形成特殊的衍射图样。通过收集衍射样中各衍射点的位置和强度,能够最终分析得出晶体中蛋白质分子的结构(如 2.4)。
本文编号:3042575
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