新型人类肠道病毒山东分离株的分子流行病学及其基因组特征研究

发布时间：2021-04-05 18:44

　　[背景]人类肠道病毒（Human Enteroviruses, HEVs）属于小RNA病毒科（Picornaviridae）肠道病毒属（Enterovirus）,目前有A、B、C、D4个组共109种血清型。HEVs抗原型别复杂,进化活跃,隶属不同组别的HEVs具有相同或相似的致病性,而导致不同疾病的HEVs在生物学特性和进化上非常相似和接近。根据HEVs抗原性及致病性的不同,最初被分为64个血清型：脊髓灰质炎病毒（Polioviruses, PV）1-3型,柯萨奇病毒A（Coxsackievirus A, CVA）1-22和24型,柯萨奇病毒B（CVB）1-6型和埃可病毒（Echovirus, Echo）1-7、9、11-21、24-27、29-33型,以及20世纪70年代后发现的新型肠道病毒（Newer Enteroviruses）EV68-71型。1999年,基于Oberste等提出的VP1基因序列的分子定型方法,许多使用传统血清学方法无法定型的HEVs（即新型HEVs）陆续被发现,目前已有50多个新型HEVs基因型,而且随着分子定型方法的推广,将来还会发现更多的新型HEVS。HE... 

【文章来源】：山东大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：172 页

【学位级别】：博士

【文章目录】：
摘要
Abstract
符号说明
前言
    一、背景
        （一） 人类肠道病毒（HEVs）的分类
        （二） 新型HEVs的致病性
        （三） 新型HEVs的流行状况
        （四） HEVs病原学及分子进化
        （五） 国内外研究现状
    二、研究目的与意义
        （一） 本研究的意义
        （二） 本研究的目的
    三、本研究的技术路线
材料与方法
    一、材料
        （一） 标本与资料来源
        （二） 细胞培养材料
        （三） 病毒分离实验材料
        （四） 中和实验材料
        （五） 核酸提取及RT-PCR实验材料
        （六） 引物设计合成
        （七） 琼脂糖凝胶电泳材料
        （八） DNA序列测定材料
        （九） 生物信息学软件
    二、方法
        （一） 细胞培养
        （二） 病毒分离
        （三） 血清学型别鉴定
        （四） 病毒核酸（RNA）的提取
        （五） 逆转录-聚合酶链反应
        （六） 琼脂糖凝胶电泳
        （七） 序列测定
        （八） 分子定型与序列提交
        （九） 系统发生学分析与同源性分析
        （十） 进化遗传学分析
        （十一） 重组分析
    三、质量控制
        （一） 实验中的质量控制
        （二） 其他步骤质量控制
结果
    一、新型HEVs山东分离株的鉴定与基因型分布
        （一） AFP监测系统来源的新型HEVs
        （二） HFMD病例来源的新型HEVs
        （三） 无菌性脑膜炎病例中的新型HEVs
    二、新型HEVs山东分离株的细胞病变特征
        （一） 细胞敏感性分析
        （二） 在敏感细胞上的CPE特征
    三、新型HEVs VP1序列分析与进化遗传学研究
        （一） EV71山东分离株遗传进化分析
        （二） EV73山东分离株遗传进化分析
        （三） EV74山东分离株遗传进化分析
        （四） EV75山东分离株遗传进化分析
        （五） EV76山东分离株遗传进化分析
        （六） EV80山东分离株遗传进化分析
        （七） EV87山东分离株遗传进化分析
        （八） EV90山东分离株遗传进化分析
        （九） EV96山东分离株遗传进化分析
        （十） EV97山东分离株遗传进化分析
    四、新型HEVs全基因组序列分析
        （一） EV71的全基因组序列分析
        （二） EV73和EV75的全基因组序列分析
        （三） EV76的全基因组序列分析
        （四） EV90的全基因组序列分析
        （五） EV96的全基因组序列分析
        （六） EV97的全基因组序列分析
讨论
    一、新型HEVs山东分离株的基因型分布
    二、新型HEVs的细胞病变特征
    三、新型HEVs的分子进化
        （一） EV71山东分离株的分子进化
        （二） 其他新型HEVs山东分离株的分子进化
    四、新型HEVs的基因组序列分析
本研究的主要创新点和不足
后续研究方向
结论与建议
附录、附表
参考文献
综述
    参考文献
致谢
攻读博士学位期间发表的学术论文
学位论文评阅及答辩情况表
外文论文


【参考文献】：
期刊论文
[1]云南省边境地区健康儿童中肠道病毒96型的鉴定及型分析[J]. 汤晶晶,田炳均,罗梅,赵智娴,张杰,庞颜坤,张丽芬,丁峥嵘.  中国病毒病杂志. 2012(01)
[2]肠道病毒71型疫苗的研发现状及进展[J]. 姚昕,毛群颖,梁争论.  中国生物制品学杂志. 2011(02)
[3]肠道病毒71型疫苗候选株和疫苗标准的研究[J]. 梁争论.  中国病毒病杂志. 2011(01)
[4]人类肠道病毒B组73、75和97型山东地方株的鉴定及其基因特征分析[J]. 陶泽新,王海岩,徐爱强,宋立志,李岩,刘桂芳,刘尧,樊庆莹.  病毒学报. 2010(01)
[5]中国国内首次分离出EV73肠道病毒[J]. 汤晶晶,丁峥嵘,田炳均,赵智娴,张杰,李立群,何丽芳.  病毒学报. 2009(06)
[6]1株新型肠道病毒的生物学特性鉴定[J]. 胡燕,侯俊,沈宏辉,白冰珂,王志杰,于晓方,貌盼勇.  传染病信息. 2009(03)
[7]新型肠道病毒[J]. 张杰,丁峥嵘,田炳均.  中华流行病学杂志. 2009 (05)
[8]云南省人类肠道病毒（EV）B组中新型EV80 EV81和EV83的分子生物学鉴定[J]. 田炳均,张杰,康文玉,赵智娴,丁峥嵘.  中国疫苗和免疫. 2008(01)
[9]云南省肠道病毒96型的分子生物学鉴定[J]. 田炳均,赵智娴,张杰,康文玉,丁峥嵘.  中国计划免疫. 2007(06)
[10]新型肠道病毒EV75的分子生物学鉴定[J]. 田炳均,吴燕,张东华,何丽芳,丁峥嵘,陆林.  中华流行病学杂志. 2007(07)



本文编号：3119904