细粒棘球绦虫棘球蚴的水通道蛋白基因研究
发布时间：2021-04-05 21:32
目的1、对细粒棘球绦虫水通道蛋白（Eg AQPs）的序列和结构特性进行生物信息学分析,为研究其生物学功能提供基础。2、筛选以RT-qPCR方法检测棘球蚴EgAQPs基因转录表达状态的内参基因,并检测EgAQPs基因在棘球蚴发育不同时间的转录表达水平,为探讨EgAQPs基因转录表达水平变化与棘球蚴液形成或积累的关系提供依据。3、克隆Eg AQPs基因,并在非洲爪蟾卵母细胞中进行异源表达以验证其水通道蛋白的功能,为研究EgAQPs基因在棘球蚴液形成或积累中的作用及机制提供基础。方法1、对Eg AQPs蛋白的序列和结构特性进行生物信息学分析,并构建进化树,以比较EgAQPs与其他物种来源的AQPs之间的亲缘关系。采用ProtParam、MotifScan、Conserved Domain、TMHMM 2.0、Prot Scale等生物信息学在线分析程序,分析EgAQPs蛋白的理化性质、翻译后修饰位点、保守结构域、跨膜结构域、亲/疏水性等。采用Clustal omega程序对不同物种来源的AQPs进行多序列比对,并通过MEGA 6.06程序构建进化树。2、采用geNorm软件分析体内外发育不同...
【文章来源】：重庆医科大学重庆市
【文章页数】：116 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
EgAQPs蛋白的亲/疏水性图
图 1-3 EgAQPs 蛋白的跨膜结构域。在 TopPred 1.10 的预测结果中，黑色的圆柱体代表确定的跨膜结构域，白色的圆柱体代表推测的跨膜结构域。在 TMPred 的预测结果中，分值大于500 的峰为跨膜结构域。在 TMHMM 2.0 的预测结果中，图形上方红色的横线代表跨膜结构域。Figure 1-3 The transmembrane regions of EgAQPs. In TopPred 1.10, barrels in blackindicate the certain transmembrane regions, barrels in white indicate the putativetransmembrane regions. In TMPred, peaks with score more than 500 represent thetransmembrane regions. In TMHMM 2.0, horizon lines in red above the figure indicate thetransmembrane regions.除跨膜结构域的相关信息外，TMHMM 2.0 和 TopPred 1.10 软件还分析了蛋白的 N-末端和 C-末端的定位。TMHMM 2.0 程序分析结果表明，除了 EgAQP1（N末端和 C 末端均位于胞外）、EgAQP9（accession number: CDS21164，N 末端和 C
EgAQPs 与人 AQP1、AQP9 的多序列比对结果。所用蛋白及登录号如下：人 number:AAX24129）、AQP9（accession number: BAA24864）、EgAQP1（aS21750）、EgAQP9 的 2 种转录本（accession number: CDS21164 和 CDS 3 种转录本（accession number: CDS21745、CDS21752 和 CDS21753）、26
【参考文献】：
期刊论文
[1]2012-2016年中国棘球蚴病抽样调查分析[J]. 伍卫平,王虎,王谦,周晓农,王立英,郑灿军,曹建平,肖宁,王莹,朱曜宇,牛彦麟,薛垂召,曾祥嫚,房琦,韩帅,余晴,杨诗杰,付青,白雪飞,田添,李军建,张梦媛,吴文婷,张山山,侯岩岩,冯宇,马宵,李斌,李凡卡,郭卫东,杨亚明,吴向林,金小林,张红卫,于石成. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2018(01)
[2]苯并咪唑类药物治疗包虫病研究进展[J]. 朱文君,韩秀敏,郭亚民. 中国血吸虫病防治杂志. 2017(04)
[3]多房棘球绦虫apomucin基因qPCR引物的筛选及潜在应用[J]. 苏梦,郭小腊,杨静,邵忠伟,丁军涛,项海涛,骆学农,郑亚东,孙晓林. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2016(05)
[4]组培条件下苹果实时定量PCR内参基因的筛选[J]. 李君英,张鹤,韩永峰,邵建柱,孙建设. 果树学报. 2016(09)
[5]松墨天牛化学感受组织荧光定量PCR内参基因的鉴定与筛选[J]. 冯波,郭前爽,毛必鹏,杜永均. 昆虫学报. 2016(04)
[6]细粒棘球绦虫未知功能基因384p02i04的克隆及生物信息学分析[J]. 刘辉,肖云峰,赵军,王建华,吕国栋. 新疆医科大学学报. 2016(04)
[7]寄生虫水孔蛋白研究进展[J]. 崔建敏,张念章,付宝权. 畜牧兽医学报. 2015(05)
[8]鹿茸组织中内参基因的筛选和验证[J]. 张然然,刘华淼,邢秀梅,胡大勇. 中国畜牧兽医. 2015(04)
[9]PCV2 Rep蛋白N-糖基化位点突变对病毒复制的影响[J]. 徐胜男,时建立,彭喆,徐绍建,吴晓燕,丛晓燕,杜以军,吴家强,李俊,王金宝. 家畜生态学报. 2015(04)
[10]细粒棘球绦虫组织蛋白酶B的重组表达及生物信息学分析[J]. 张颋,贾利芳,陈英,鞠川,莫筱瑾,徐斌,陈绅波,陈军虎,胡薇. 中国血吸虫病防治杂志. 2014(06)
博士论文
[1]应用SSH技术研究氧化胁迫下细粒棘球蚴基因的表达[D]. 侯秋莲.新疆大学 2008
硕士论文
[1]旋毛虫水孔蛋白基因的克隆、表达及鉴定[D]. 崔建敏.中国农业科学院 2016
[2]蛋白质翻译后修饰位点预测及其功能分析[D]. 索生宝.南昌大学 2013
[3]豆蔻酰化修饰及质膜结合在烟草小GTP结合蛋白基因NtRab5b转录调控中的作用[D]. 贺亮亮.中国科学技术大学 2011
[4]细粒棘球绦虫抗原B8-KDa亚单位在虫体发育过程中的选择性表达[D]. 张海涛.新疆医科大学 2009
本文编号：3120140
【文章来源】：重庆医科大学重庆市
【文章页数】：116 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
EgAQPs蛋白的亲/疏水性图
图 1-3 EgAQPs 蛋白的跨膜结构域。在 TopPred 1.10 的预测结果中，黑色的圆柱体代表确定的跨膜结构域，白色的圆柱体代表推测的跨膜结构域。在 TMPred 的预测结果中，分值大于500 的峰为跨膜结构域。在 TMHMM 2.0 的预测结果中，图形上方红色的横线代表跨膜结构域。Figure 1-3 The transmembrane regions of EgAQPs. In TopPred 1.10, barrels in blackindicate the certain transmembrane regions, barrels in white indicate the putativetransmembrane regions. In TMPred, peaks with score more than 500 represent thetransmembrane regions. In TMHMM 2.0, horizon lines in red above the figure indicate thetransmembrane regions.除跨膜结构域的相关信息外，TMHMM 2.0 和 TopPred 1.10 软件还分析了蛋白的 N-末端和 C-末端的定位。TMHMM 2.0 程序分析结果表明，除了 EgAQP1（N末端和 C 末端均位于胞外）、EgAQP9（accession number: CDS21164，N 末端和 C
EgAQPs 与人 AQP1、AQP9 的多序列比对结果。所用蛋白及登录号如下：人 number:AAX24129）、AQP9（accession number: BAA24864）、EgAQP1（aS21750）、EgAQP9 的 2 种转录本（accession number: CDS21164 和 CDS 3 种转录本（accession number: CDS21745、CDS21752 和 CDS21753）、26
【参考文献】：
期刊论文
[1]2012-2016年中国棘球蚴病抽样调查分析[J]. 伍卫平,王虎,王谦,周晓农,王立英,郑灿军,曹建平,肖宁,王莹,朱曜宇,牛彦麟,薛垂召,曾祥嫚,房琦,韩帅,余晴,杨诗杰,付青,白雪飞,田添,李军建,张梦媛,吴文婷,张山山,侯岩岩,冯宇,马宵,李斌,李凡卡,郭卫东,杨亚明,吴向林,金小林,张红卫,于石成. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2018(01)
[2]苯并咪唑类药物治疗包虫病研究进展[J]. 朱文君,韩秀敏,郭亚民. 中国血吸虫病防治杂志. 2017(04)
[3]多房棘球绦虫apomucin基因qPCR引物的筛选及潜在应用[J]. 苏梦,郭小腊,杨静,邵忠伟,丁军涛,项海涛,骆学农,郑亚东,孙晓林. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2016(05)
[4]组培条件下苹果实时定量PCR内参基因的筛选[J]. 李君英,张鹤,韩永峰,邵建柱,孙建设. 果树学报. 2016(09)
[5]松墨天牛化学感受组织荧光定量PCR内参基因的鉴定与筛选[J]. 冯波,郭前爽,毛必鹏,杜永均. 昆虫学报. 2016(04)
[6]细粒棘球绦虫未知功能基因384p02i04的克隆及生物信息学分析[J]. 刘辉,肖云峰,赵军,王建华,吕国栋. 新疆医科大学学报. 2016(04)
[7]寄生虫水孔蛋白研究进展[J]. 崔建敏,张念章,付宝权. 畜牧兽医学报. 2015(05)
[8]鹿茸组织中内参基因的筛选和验证[J]. 张然然,刘华淼,邢秀梅,胡大勇. 中国畜牧兽医. 2015(04)
[9]PCV2 Rep蛋白N-糖基化位点突变对病毒复制的影响[J]. 徐胜男,时建立,彭喆,徐绍建,吴晓燕,丛晓燕,杜以军,吴家强,李俊,王金宝. 家畜生态学报. 2015(04)
[10]细粒棘球绦虫组织蛋白酶B的重组表达及生物信息学分析[J]. 张颋,贾利芳,陈英,鞠川,莫筱瑾,徐斌,陈绅波,陈军虎,胡薇. 中国血吸虫病防治杂志. 2014(06)
博士论文
[1]应用SSH技术研究氧化胁迫下细粒棘球蚴基因的表达[D]. 侯秋莲.新疆大学 2008
硕士论文
[1]旋毛虫水孔蛋白基因的克隆、表达及鉴定[D]. 崔建敏.中国农业科学院 2016
[2]蛋白质翻译后修饰位点预测及其功能分析[D]. 索生宝.南昌大学 2013
[3]豆蔻酰化修饰及质膜结合在烟草小GTP结合蛋白基因NtRab5b转录调控中的作用[D]. 贺亮亮.中国科学技术大学 2011
[4]细粒棘球绦虫抗原B8-KDa亚单位在虫体发育过程中的选择性表达[D]. 张海涛.新疆医科大学 2009
本文编号：3120140
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