耐甲氧西林金黄色葡萄球菌EsxA蛋白的生物学信息预测

发布时间：2021-06-22 08:55

　　目的在线软件分析耐甲氧西林金黄色葡萄球菌EsxA蛋白的生物学信息,为防治金黄色葡萄球菌感染提供理论基础。方法采用在线分析系统蛋白质EXPASYP Protemic（http://www. espasy. org）中的Protparam（http://expasy.org/tools/protparam.html）,分析耐甲氧西林金黄色葡萄球菌EsxA蛋白的分子质量、分子式,氨基酸数目、等电点、正负电荷残基,预测该蛋白的稳定性等理化性质;利用在线分析蛋白质软件Protscale（http://www.espasy.org/cgibin/protscale.p1）分析EsxA蛋白亲（疏）水性;采用SOPMA软件预测和分析耐甲氧西林金黄色葡萄球菌EsxA蛋白的二、三级结构。结果 EsxA蛋白二级结构α螺旋（Hh）占26.15%（68个）,延伸链（Ee）占32.69%（85个）,无规则卷曲（Cc）占33.46%（87个）。蛋白分子质量为30 428.46 ku;理论pI值为8.18;氨基酸序列Ala占1.9%,Arg占1.9%,Val占3.5%。可能是亲水性蛋白;预测耐甲氧西林金黄色葡萄球菌E... 

【文章来源】：中国校医. 2020,34(02)

【文章页数】：4 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 基因信息
    1.2 生物学信息预测
        1.2.1 基因及蛋白序列
        1.2.2 蛋白的理化性质及亲（疏）水性分析
        1.2.3 蛋白的跨膜区、信号肽分析
        1.2.4 蛋白的糖基化及磷酸化生物信息学分析
        1.2.5 蛋白的二级结构预测
        1.2.6 蛋白的三级结构预测及建模
2 结果
    2.1 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌EsxA蛋白的氨基酸序列
    2.2 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌EsxA蛋白的理化性质及亲（疏）水性
    2.3 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌EsxA蛋白的跨膜结构域与信号肽
    2.4 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌EsxA蛋白的糖基化和磷酸化分析
    2.5 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌EsxA蛋白的二级结构
    2.6 预测MRSAEsxA蛋白三级结构
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]皮肤软组织感染患者金黄色葡萄球菌感染状况研究[J]. 万东芳,万永山,朱红军,王凤娥,侯建明.  中华医院感染学杂志. 2019(01)
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[3]幽门螺杆菌CagA基因编码蛋白的生物信息学分析[J]. 阿孜尔古丽·阿布都克日木,阿布都哈巴尔·阿布都克日木,刘玉梅,许海峰,孜拜旦·吐尔逊,热比亚·努力,孜来古丽·米吉提,德力夏提·依米提,于涛.  中国病原生物学杂志. 2018(03)
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[5]金黄色葡萄球菌ClfA蛋白Th表位鉴定及其免疫原性分析（英文）[J]. 李扬,李志杰,李亚刚,叶军锋.  微生物学报. 2013(09)



本文编号：3242547