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Cidec基因敲除小鼠肠道菌群的特征

发布时间:2022-01-20 12:45
  目的:探究Cidec敲除(CIDEC-KO)小鼠肠道菌群的结构。方法:随机分别挑选体重相近、2月龄5只野生型和5只Cidec敲除的雄性小鼠,收集两种基因型小鼠经高脂饲料16周喂养前后的新鲜粪便。提取粪便中的细菌基因组,对菌群基因组16S r RNA基因V4高变区进行测序,对数据进行PCoA分析、Alpha多样性分析及LEf Se分析。结果:属水平下的LEf Se分析显示,在普通饲料喂养条件下,Cidec缺失小鼠对比野生型小鼠粪便中PrevotellaceaUCG001属丰度显著上升,Blautia属、Streptococcus属、LachnospiraceaeUCG006属丰度显著下降。与同月龄同高脂喂养的野生型小鼠比,Cidec敲除小鼠粪便中RuminococcaceaeUCG014属丰度显著下降。进一步比较同一种基因型下饮食对肠道菌群的改变,发现在喂养高脂饲料后,某些属的丰度仅在Cidec缺失小鼠中发生显著变化,但是在野生型小鼠中未发现有显著变化,这些... 

【文章来源】:现代生物医学进展. 2020,20(03)

【文章页数】:7 页

【部分图文】:

Cidec基因敲除小鼠肠道菌群的特征


Alpha多样性分析高脂及普通饲料喂养条件下野生型以及Cidec敲除小鼠肠道菌群

肠道菌群,饲料,条件,聚类分析


图1 Alpha多样性分析高脂及普通饲料喂养条件下野生型以及Cidec敲除小鼠肠道菌群2.4 高脂饲料喂养条件下野生型小鼠和Cidec敲除小鼠粪便中的差异物种

肠道菌群,野生型,饲料,粪便


2.5 野生型小鼠及Cidec缺失小鼠在高脂饲料喂养前后粪便中的差异物种通过LEf Se进一步分析比较同一种基因型下饮食对肠道菌群的改变,图5和图6分别显示高脂喂养前后的野生型及Cidec缺失小鼠粪便中在属水平下显著变化的菌群,并根据LEf Se分析结果绘制两个基因型的肠道菌群在高脂喂养后变化菌属的韦恩图如图6所示。

【参考文献】:
期刊论文
[1]Ablation of gut microbiota alleviates obesity-induced hepatic steatosis and glucose intolerance by modulating bile acid metabolism in hamsters[J]. Lulu Sun,Yuanyuan Pang,Xuemei Wang,Qing Wu,Huiying Liu,Bo Liu,George Liu,Min Ye,Wei Kong,Changtao Jiang.  Acta Pharmaceutica Sinica B. 2019(04)
[2]Inulin Can Alleviate Metabolism Disorders in ob/ob Mice by Partially Restoring Leptinrelated Pathways Mediated by Gut Microbiota[J]. Xiaofeng Song,Liang Zhong,Na Lyu,Fei Liu,Boxing Li,Yanan Hao,Yong Xue,Jing Li,Yuqing Feng,Yue Ma,Yongfei Hu,Baoli Zhu.  Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2019(01)



本文编号:3598851

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