基于生物信息学分析的hsa-miR-206靶基因预测

发布时间：2023-02-07 20:47

　　目的应用生物信息学方法分析hsa-miR-206序列,并进行靶基因功能富集分析、信号通路富集分析,靶基因编码蛋白相互作用分析,为后续研究其功能提供理论基础。方法通过miRbase、Target Scan、DIANA-microT、MiRDB据库、VENN在线工具、DAVID在线数据库、STRING数据库及Cytoscape软件等在线工具分析hsa-miR-206序列及保守性,预测其靶基因,对预测的靶基因进行功能富集分析(GO分析)、KEGG通路富集分析,并筛选出关键基因。结果 hsa-miR-206序列在各物种间高度保守,GO分析发现hsa-miR-206靶基因功能主要富集在生物合成调节、有机物代谢过程调节、转录调节等生物学过程,KEGG分析表明主要参与Wnt信号通路、T细胞受体信号通路、癌症通路等。蛋白互作显示编码蛋白间存在复杂的相互作用,与hsa-miR-206关系最密切的蛋白有27个,如天冬氨酸-谷氨酸-丙氨酸-天冬氨酸盒解螺旋酶5(DDX5)、人远端上游原件结合蛋白(FUBP1)、天冬氨酸-谷氨酸-丙氨酸-组氨酸盒解螺旋酶15(DHX15)等。结论 hsa-miR-206可能参...

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【文章目录】：
0 引言
1 材料与方法
    1.1 miR-206的序列保守性分析
    1.2 miR-206的靶基因预测
    1.3 miR-206靶基因的GO功能注释及KEGG通路富集分析
    1.4 关键靶基因筛选
2 结果
    2.1 miR-206的染色体定位及序列保守性分析
    2.2 hsa-miR-206的靶基因预测结果
    2.3 hsa-miR-206靶基因GO功能注释和KEGG通路富集分析
    2.4 miR-206预测靶基因所编码蛋白质间的相互作用分析
3 讨论



本文编号：3737402