巨噬细胞与单核细胞的细胞骨架调控相关的差异基因表达

发布时间：2023-02-08 17:21

　　目的:分析单核细胞(Mo)向巨噬细胞(Mφ)分化的过程中,细胞骨架的调控相关基因及信号通路的表达变化。方法:CEO数据库获得Mo和Mφ的芯片数据,经RStudio软件分析获得差异表达基因(DEGenes),利用STRING在线工具对DEGenes构建蛋白质相互作用网络(PPI),Cytoscap软件筛选出DEGenes的核心模块;对筛选出的DEGenes的核心模块进行GO和KEGG分析。结果:Mφ相对于Mo的差异表达基因共476个,主要涉及的信号通路包括NOD样受体信号通路和吞噬体信号通路,这些通路中CCL18、CXCL8和C3等相关基因与细胞骨架的调控密切相关。结论:Mo向Mφ分化过程中细胞骨架调控相关基因的表达发生了显著改变。

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【文章目录】：
1 资料和方法
    1.1 资料
    1.2 方法
        1.2.1 分析芯片数据差异基因
        1.2.2 构建蛋白质相互作用网络
        1.2.3 GO和KEGG富集分析DEGenes的核心模块
2 结果
    2.1 经RStudio软件获得DEGenes
    2.2 构建PPI
    2.3 GO和KEGG富集分析DEGenes
3 讨论



本文编号：3738078