粉尘螨长链脂肪酸转运蛋白基因克隆及序列分析

发布时间：2023-03-28 20:54

　　目的获得粉尘螨长链脂肪酸转运蛋白(long-chain fatty acid transport protein,FATP)编码基因及其分子特征。方法根据粉尘螨转录组基因测序结果,获得FATP编码序列片段,据此设计引物,用反转录-聚合酶链式反应从粉尘螨总RNA中扩增全长基因片段,构建原核表达质粒pET28a(+)-FATP。成功获取FATP序列后,利用Expasy、SingaIP 5.0、GOR4和TMpred等软件进行氨基酸序列结构和功能分析,最后利用Clustal Omega及MEGA-X软件进行同源性分析。结果基因编码序列全长1 071 bp,编码的蛋白质由356个氨基酸组成,其亲水性指数为-0.39,此蛋白为可溶性蛋白,结构稳定,二级结构包括α-螺旋(25.56%)、延伸主链(23.04%)和无规则卷曲(51.40%)。该蛋白存在两处较明显的跨膜区段,由外向内的跨膜区位于1～20位氨基酸,由内向外的跨膜区在100～116位氨基酸。同源氨基酸序列构建的分子进化树中发现与家蚕聚成一簇。结论获得了粉尘螨FATP编码基因全长及其分子特征,为探讨粉尘螨生理现象、开发粉尘螨控制措施奠定基础...

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 粉尘螨总RNA提取
        1.2.2 反转录
        1.2.3 PCR扩增全长目的基因
        1.2.4 克隆质粒的构建及鉴定测序
    1.3 生物信息学分析
2 结果
    2.1 核酸序列克隆测序
    2.2 氨基酸序列推导及功能分析
    2.3 同源性分析及进化树构建
3 讨论



本文编号：3773269