埃及伊蚊yellow基因家族的鉴别和表达谱分析
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【摘要】:目的筛选并鉴定埃及伊蚊(Aedes aegypti)全基因组中的yellow基因,分析其基因结构、基因进化以及在不同发育时期和不同组织的表达谱。方法运用模式昆虫黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)Dmyellow基因(Gen Bank登录号为AAF45497)王浆主蛋白(MRJP)结构域氨基酸序列,在埃及伊蚊全基因组数据库中筛选并鉴定埃及伊蚊yellow基因家族,采用Ex PASy在线相关工具包分析其理化性质和结构域,运用Signal P4.1预测信号肽,结合使用DNAstar、MAGA6.0和Gene Doc软件包进行同源性比对、保守性分析和系统进化树构建。提取埃及伊蚊总RNA,合成c DNA,利用实时荧光定量PCR(q RT-PCR)法对埃及伊蚊不同发育时期(卵、Ⅰ~Ⅳ龄幼虫、蛹以及未吸血雌蚊和雄蚊)和未吸血雌蚊不同组织(唾液腺、中肠、脂肪体和卵巢)的yellow基因表达谱进行相对定量分析。结果从埃及伊蚊全基因组中筛选出12条yellow基因(Aa-yellow、Aa-yellow-b、Aayellow-c、Aa-yellow-d、Aa-yellow-e、Aa-yellow-f2、Aa-yellow-fb、Aa-yellow-fc、Aa-yellow-g、Aa-yellow-g2、Aa-yellow-h和Aa-yellow-x)。生物信息学分析结果显示,12条yellow基因均具有MRJP结构域和信号肽序列。同源性比对结果显示,埃及伊蚊yellow基因家族成员间同源性较低,为15%~49%;但其保守域间同源性较高,可达60%。系统进化树分析结果显示,12个YELLOW蛋白分为5个亚家族,其中11个在黑腹果蝇中均有直系同源蛋白存在。q RT-PCR结果显示,Aa-yellow-d和Aa-yellow-x在雄蚊中高表达(P0.01或P0.05),相对表达量分别为0.018 9和0.023 5;Aa-yellow-fc在雌蚊和唾液腺中特异高表达(P0.01),相对表达量分别为0.024 8和0.034 9;Aa-yellow-f2在Ⅱ龄幼虫中特异高表达(P0.01),相对表达量为0.093 4;Aa-yellow、Aa-yellow-e和Aa-yellow-fb在Ⅲ龄幼虫中特异高表达(P0.01),相对表达量分别为0.562 1、0.004 4和0.008 4;Aa-yellow、Aa-yellow-e、Aa-yellow-f2、Aayellow-fb、Aa-yellow-h和Aa-yellow-x等6条基因在卵巢中高表达(P0.01或P0.05),相对表达量分别为0.569 4、0.027 0、0.006 5、0.001 0、0.084 8和0.015 1;除Aa-yellow-c(0.004 0)和Aa-yellow-x(0.007 4)外,其余基因几乎不在中肠表达。结论在埃及伊蚊基因组中获得的12条yellow基因同源性较低,且在不同发育时期和不同组织中表达有差异。
【作者单位】: 贵州医科大学基础医学院人体寄生虫学教研室贵州医科大学现代病原生物学实验室;
【关键词】: 埃及伊蚊 yellow基因家族 qRT-PCR 表达谱
【基金】:国家自然科学基金(No.81260260)~~
【分类号】:R384.1
【正文快照】: yellow基因家族主要存在于昆虫基因组中,是在。研究显示,YELLOW蛋白家族成员在长须鲁蛉当前研究较为热门的基因家族之一。在部分真菌和(Lutzomyia longipalpis)唾液腺中丰富表达[22],其中耐辐射球菌(Deinococcus radiodurans)也发现同源LJM11蛋白已被证实具有抗凝血和逃避宿主
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