柯萨奇病毒A组16型抗原表位预测
发布时间:2024-06-15 04:13
目的应用模拟表位策略研究柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CA16)抗原表位。方法分别以具有中和活性的抗CA16单克隆抗体2C6、4F9、1D8为靶分子,在噬菌体12肽库中淘选可与之特异性结合的阳性克隆,对淘选得到的阳性克隆进行序列测定和比对,并采用Phage ELISA法进行特异性鉴定。同时利用生物信息学方法对CA16衣壳蛋白理化性质进行分析,并与阳性噬菌体多肽序列和结构进行比对,预测CA16中和抗原表位。结果经噬菌体12肽库筛选,单克隆抗体2C6、4F9、1D8淘选阳性噬菌体富集率分别为2.39×103、1.32×104和3.762×10,获得可与单克隆抗体2C6、4F9、1D8结合的阳性克隆分别为10、11、6种,其中各组共有基序分别为K+X+WW和N/Q+S/T+Y/F/W、K+X+WW+D/E、T+X+P+W。Phage ELISA特异性鉴定阳性克隆肽CA1和CB1、FB3和FC3、DA1和DA2、DA5分别强特异性结合单克隆抗体2C6、4F9、1D8。经计算机预测分析,确定了主要位于CA16 VP1 80...
【文章页数】:6 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 主要试剂
1.2 噬菌体肽库的液相亲和筛选
1.3 阳性噬菌体克隆肽序列分析
1.4 阳性噬菌体克隆的特异性鉴定
1.5 CA16抗原中和表位分析
1.5.1 CA16抗原蛋白分析
1.5.2 CA16抗原表位预测
1.5.3 CA16中和抗原表位定位
1.5.4 可视化分析
2 结果
2.1 噬菌体肽库的液相亲和淘选
2.2阳性噬菌体克隆肽序列分析
2.3 阳性噬菌体克隆的特异性鉴定
2.4 CA16抗原中和表位分析
2.4.1 CA16抗原蛋白分析
2.4.2 CA16抗原表位预测
2.4.3 CA16中和抗原表位定位
2.4.4 可视化分析
3 讨论
本文编号:3994909
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1 材料与方法
1.1 主要试剂
1.2 噬菌体肽库的液相亲和筛选
1.3 阳性噬菌体克隆肽序列分析
1.4 阳性噬菌体克隆的特异性鉴定
1.5 CA16抗原中和表位分析
1.5.1 CA16抗原蛋白分析
1.5.2 CA16抗原表位预测
1.5.3 CA16中和抗原表位定位
1.5.4 可视化分析
2 结果
2.1 噬菌体肽库的液相亲和淘选
2.2阳性噬菌体克隆肽序列分析
2.3 阳性噬菌体克隆的特异性鉴定
2.4 CA16抗原中和表位分析
2.4.1 CA16抗原蛋白分析
2.4.2 CA16抗原表位预测
2.4.3 CA16中和抗原表位定位
2.4.4 可视化分析
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