云南省恶性疟原虫青蒿素耐药性相关基因K13 kelch结构域序列多态性的分析

发布时间：2017-06-05 19:10

  本文关键词：云南省恶性疟原虫青蒿素耐药性相关基因K13 kelch结构域序列多态性的分析，，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：目的分析云南省恶性疟现症病例中恶性疟原虫(Plasmodium falciparum)K13基因kelch结构域的序列多态性,为掌握云南省恶性疟青蒿素耐药性提供依据。方法2013年1月-2015年12月,从云南省16个州(市)收集恶性疟现症病例的滤纸血样和相关信息,通过流行病学调查判定其感染来源,根据中国疾病预防控制信息系统疫情登记确认病例发现地。使用巢式PCR扩增恶性疟原虫K13基因kelch结构域并测序,与恶性疟原虫标准株3D7(PF3D7_1343700)序列进行比对。使用Mega 5.04分析序列多态,计算序列间变异位点、遗传距离等,计算氨基酸突变位点构成比并进行χ~2检验。结果2013-2015年共收集恶性疟现症病例血样202例,190例为输入性病例,12例为云南本地感染病例,各年的病例构成比分别为30.7%(62/202)、34.2%(69/202)和35.1%(71/202),呈逐年增多趋势。192例血样K13基因kelch结构域巢式扩增阳性,190例测序成功,66例存在K13基因错义突变,突变率为34.7%(66/190)。各年的突变病例检出构成比分别为40.9%(27/66)、37.9%(25/66)和21.2%(14/66),呈逐年减少趋势。共检出F446I、A578S、N458Y、P574L、A676D、G449A、C469Y、V566I、E556D和S16L等10种突变型,突变率最高的为F446I,占72.7%(48/66)。F446I突变型在18~56岁、农民、感染地为东南亚等病例中的检出比例分别为58.3%(28/48)、70.8%(34/48)和91.7%(44/48),高于同组其他病例的41.7%(20/48)、29.2%(14/48)和8.3%(4/48)(χ~2=4.633、5.556、5.152,P0.05)。190例K13基因kelch结构域的同源性片段为248 bp,其中保守位点占94.8%(235/248),变异位点占5.2%(13/248),简约信息位点占2.0%(5/248),单态位点占3.2%(8/248)。190例DNA序列间遗传距离为0.000~0.036,平均为(0.001±0.001)。结论云南省恶性疟现症病例的K13基因kelch结构域存在10种突变型,以F446I位点突变最常见。
【作者单位】： 大理大学病原与媒介生物研究所普洱分部;云南省寄生虫病防治所 云南省疟疾研究中心 云南省虫媒传染病防控研究重点实验室;
【关键词】： 恶性疟原虫 青蒿素 耐药性 基因 多态 分析 云南省
【基金】：国家自然科学基金国际(地区)合作与交流项目(No.81220108019);国家自然科学基金地区科学基金项目(No.81660559) 云南省科技项目应用基础计划青年项目(No.Y0120150295)~~
【分类号】：R382.31
【正文快照】： 自20世纪60、70年代起,一些疟疾地方性流行区逐渐出现耐药性疟原虫,并呈迅速蔓延的趋势[1]。迄今,已发现恶性疟原虫(Plasmodium falciparum)对所有抗疟药产生了不同程度的耐药性。云南是全球继南美、东南亚之后发现的抗氯喹恶性疟长期流行地区之一[2-5],至1983年,抗氯喹恶性疟

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本文编号：424423