人巨细胞病毒临床株UL133基因序列遗传变异分析

发布时间：2017-06-06 04:09

  本文关键词：人巨细胞病毒临床株UL133基因序列遗传变异分析，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：目的研究人巨细胞病毒(HCMV)临床感染株的UL133基因序列特征。方法采集HCMV-DNA阳性者的临床标本,PCR扩增UL133基因全序列,阳性扩增产物克隆到pEASYTM载体后进行序列测定,结合来自于NCBI数据库的15条序列进行UL133基因多态性分析。结果获得20例HCMV感染者的UL133全长序列。多态性分析显示HCMV临床株UL133基因核苷酸变异率为0~9.7%,氨基酸变异率为0~40.2%;不同感染者UL133序列5'端的第32-45位发生了相对集中的非同义突变,其他部分序列较少出现氨基酸缺失及错义突变。其中1例临床感染者UL133序列在163-166位核苷酸出现移码突变。综合NCBI数据库的15株序列分析显示,UL133序列分为G1、G2、G3、G4、G5、G6等6个型,但未发现基因型与HCMV感染的临床表现具有显著关联性。编码蛋白翻译后修饰位点包括酪蛋白激酶磷酸化位点(CKP),蛋白激酶C位点(PKC)以及NLS_BP核定位信号(NLS_BP)。与Toledo株相比,有1株发生移码突变,其他临床株UL133基因编码产物翻译后修饰位点相对保守。结论 HCMV UL133基因核苷酸序列及其编码的氨基酸序列高度保守,但仍具有一定的多态性。这种多态性与HCMV感染临床症状的关系尚待进一步研究。
【作者单位】： 温州医科大学微生物学和免疫学教研室;温州医科大学第二临床医学院;温州医科大学基础医学实验中心;温州医科大学附属第二医院检验科;
【关键词】： 人巨细胞病毒 UL基因 多态性
【基金】：国家自然科学基金项目(No.81472308) 浙江省自然科学基金项目(No.LQ16H190003) 温州市科技局项目(No.Y20170744) 浙江省大学生新苗计划项目(No.2014R413058,2015R413069)
【分类号】：R373
【正文快照】： 3温州医科大学基础医学实验中心,浙江温州325035;4温州医科大学附属第二医院检验科,浙江温州325000)***ymorphism of the UL133gene of HCMV and clinical symptoms of HCMV infection need to be investigated further.人巨细胞病毒(human cytomegalovirus,HCMV)属于疱疹病毒

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