结核分枝杆菌TrpD蛋白的生物信息学分析

发布时间：2017-07-30 17:17

  本文关键词：结核分枝杆菌TrpD蛋白的生物信息学分析

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【摘要】：目的应用生物信息学软件预测结核分枝杆菌TrpD基因编码蛋白的结构和功能。方法应用Protparam程序预测TrpD蛋白的理化性质,利用SignaIP 4.1和MotifScan分析其信号肽和磷酸化位点,应用ClustalX、MEGA5.1软件分析TrpD蛋白的同源性等。结果 TrpD蛋白共370个氨基酸,分子式为C1652H2651N493O500S10,理论等电点为5.99,脂溶性系数93,不稳定系数28.86,预测该蛋白为稳定蛋白。TrpD蛋白无信号肽,其二级结构中β-转角占6.76%,无规则卷曲占32.7%。氨基酸序列中有5个潜在的B细胞抗原表位,13个Th细胞表位,22个磷酸化位点,与麻风杆菌和耻垢分枝杆菌的同源性分别为80.1%和76.6%。结论初步预测结核分枝杆菌TrpD为稳定蛋白,含有T、B细胞抗原表位,为抗结核新药的潜在作用靶标。
【作者单位】： 潍坊医学院医学检验学系;潍坊医学院临床学院病原生物学教研室;
【关键词】： 结核分枝杆菌 TrpD蛋白 生物信息学 分析
【基金】：国家自然科学基金项目(No.81470001、81170080)
【分类号】：R378.911
【正文快照】： ***目前结核病仍是威胁全球公共卫生健康的疾病之一。2015年WHO结核病统计报告显示,2014年全球共有960万人感染肺结核,我国新发病例为93万,位居全球第三位,是22个高负担国家之一[1]。因此,深入研究结核分枝杆菌(Mycobacterium tu-berculosi,MTB)结构,发现新的治疗结核病的分子，

本文编号：595317