黑龙江地区人群HLA-A、B、DRB1高分辨等位基因及单体型多态性研究

发布时间：2017-08-07 03:07

  本文关键词：黑龙江地区人群HLA-A、B、DRB1高分辨等位基因及单体型多态性研究

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【摘要】：目的:研究中国造血干细胞捐献者资料库黑龙江分库无关捐献者HLA-A、B、DRB1高分辨等位基因和单体型频率分布特征。方法:采用PCR-测序分型技术(SBT)对13 670名随机、无血缘关系、健康的中华骨髓库黑龙江分库造血干细胞捐献者进行HLA-A、B、DRB1高分辨基因分型,利用计数法和最大似然性原理方法分别计算HLA-A、B、DRB1等位基因及单体型频率。结果:共观察到286个HLA等位基因,其中频率0.1的A、B、DRB1座位特异性分别为A*02∶01、A*24∶02、A*11∶01、DR*07∶01、DR*09∶01、DR*15∶01。1 087条A-B单体型中,22条单体型的频率高于0.01,267条单体型呈现显著的正连锁不平衡(ALD0,HF≥1.09×10-4,χ23.84),12条表现为强连锁不平衡(RLD0.80);1 329条B-DRB1单体型中,19条单体型的频率高于0.01,357条单体型呈现显著的正连锁不平衡,18条表现为强连锁不平衡(RLD0.80);4 428条A-BDRB1单体型中,1 348条单体型有意义(频率≥1.09×10-4),17条单体型频率高于0.005。结论:获得黑龙江地区人群HLAA、B、DRB1高分辨等位基因频率和单体型分布数据及相关遗传参数,等位基因和单体型的分布特征接近北方汉族人群,但具有其自身分布特征。
【作者单位】： 哈尔滨市血液中心;
【关键词】： HLA-A/B/DRB 高分辨基因分型 基因/单体型频率
【基金】：黑龙江省卫生厅科研课题(No.2012-082)
【分类号】：R394
【正文快照】： HLA系统是迄今所知人类基因中多态性最复杂的遗传系统,其等位基因频率及其连锁不平衡特点在不同种族、民族、地域存在明显差异。其多态性及分布差异是自然选择造成的,它保证了种群能产生对各种病原体特异的免疫应答,以维持群体的稳 定性。因此,一个群体高分辨水平的HLA多态性

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 杨剑豪;刘[?;郑皆炜;谢军华;孙瑛;姜跃琴;唐晴钧;杜可明;;4082名上海骨髓库汉族无关供者HLA-A、B、DRB1高分辨等位基因及单体型多态性研究[J];中国输血杂志;2012年12期

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 戎霞;黄珂;黄杰庭;熊华平;叶欣;郑优荣;花文峰;汪传喜;贝春花;付涌水;;HLA-A*11:01-B*15:02单倍型与丙型肝炎病毒感染风险呈负相关[J];中国免疫学杂志;2013年10期

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1 刘芳;HLA-DRB1*08/16等位基因与广西肝癌家族聚集性的相关性研究[D];广西医科大学;2014年

【二级参考文献】

中国期刊全文数据库 前2条

1 孙继丽;杜可明;傅敏;孙瑛;金晔;谢军华;季芸;杨健豪;稽月华;张铮;毛臻;刘达庄;钱开诚;;20596名汉族造血干细胞供者HLA多态性统计学分析[J];中国输血杂志;2006年05期

2 杨剑豪;刘[?;孙瑛;谢军华;郑皆炜;陆瑶;杜可明;;5186例上海汉族无关脐带血HLA基因多态性研究[J];中国输血杂志;2011年12期

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 王瑞省,吴凌云,张继红,章祥荪;单体型装配问题及其算法(英文)[J];高校应用数学学报A辑(中文版);2004年S1期

2 姜文锡;邱长春;程祖亨;周文郁;顾明亮;许群;方鸣武;牛文全;玛依拉;;载脂蛋白B基因单体型与中国维吾尔族自然长寿的关联研究[J];中国科学C辑:生命科学;2006年05期

3 杨英杰;;单体型装配问题的研究现状[J];铜仁学院学报;2011年02期

4 李珍萍,王勇,赵玉英,章祥荪;单体型推断问题与配对图(英文)[J];高校应用数学学报A辑(中文版);2004年S1期

5 甄建新;何柳媚;王大明;徐筠娉;邓志辉;;中国南方汉族人群KIR基因多态性的研究[J];中国输血杂志;2012年S1期

6 胡劲松,党娜娜,黄辰,宋土生;国际人类基因组单体型图计划[J];国外医学.遗传学分册;2005年03期

7 杨剑豪;刘[?;孙瑛;谢军华;郑皆炜;陆瑶;杜可明;;5186例上海汉族无关脐带血HLA基因多态性研究[J];中国输血杂志;2011年12期

8 杜胜军;惠汝太;;关联性研究中的单体型分析[J];中国分子心脏病学杂志;2006年04期

9 刘杰;张春燕;侯玲;李勇;张翅;;黑龙江地区汉族HLA-A、B、DRB1基因及单倍型的研究与应用[J];中国输血杂志;2009年03期

10 李彩霞;黎培兴;方积乾;;基于单体型重构的传递不平衡检验[J];中山大学学报(自然科学版);2007年04期

中国重要会议论文全文数据库 前10条

1 龚莎莎;张婷;郑静;吕建新;管敏鑫;;氨基糖甙类抗生素耳毒性相关的线粒体DNA继发突变[A];遗传学与社会可持续发展——2010中国青年遗传学家论坛论文摘要汇编[C];2010年

2 邓立彬;高扬;马素芳;张悦正;康健;曾长青;;应用单体型图进行疾病相关基因和基因组结构变异的定位研究[A];中国遗传学会“发育、遗传和疾病”研讨会论文汇编集[C];2007年

3 陈慧峰;林育纯;林丽娜;李文;罗洁;张树江;万建新;陈雯;林忠宁;;广东汉族人群PP2A-Aα亚基基因5'-侧翼区多态性的单体型分析[A];广东省环境诱变剂学会、广东省预防医学会卫生毒理专业委员会2010年学术会议资料汇编[C];2010年

4 徐新娟;梁晓慧;陈玉岚;珠勒皮亚;李素华;;VEGF基因单核苷酸多态性及其单体型与新疆维吾尔族长寿的关联研究[A];第十三次全国心血管病学术会议论文集[C];2011年

5 聂晶;胡扬;何子红;李燕春;衣龙燕;许春燕;王海燕;;VEGF基因单核苷酸多态性及单体型与杰出有氧运动能力的关联研究[A];第九届全国体育科学大会论文摘要汇编(2)[C];2011年

6 陈慧峰;林育纯;张树江;李晓杰;罗洁;林丽娜;李文;胡耀明;陈雯;林忠宁;;PPP2R1A基因启动子区高甲基化对其不同单体型转录功能活性影响[A];全国生化/工业与卫生毒理学学术会议论文集[C];2010年

7 林育纯;陈慧峰;方飞;林丽娜;陈雯;凌文华;Baitang Ning;Fred F Kadlubar;林忠宁;;磺酸基转移酶1A1基因启动子区SNPs位点单体型及其功能分析[A];遗传学进步与人口健康高峰论坛论文集[C];2007年

8 孙瞳;高扬;谭文;马素芳;张雪梅;王永岗;张清润;郭永丽;赵丹;曾长青;林东昕;;染色体11q22基质金属蛋白酶基因簇单体型与肺癌发生发展风险(英文)[A];第四届中国肿瘤学术大会暨第五届海峡两岸肿瘤学术会议教育集[C];2006年

9 张继红;吴凌云;王勇;李珍萍;章祥荪;;由基因型SNP数据推断相应单体型的Markov链统计方法(英文)[A];中国运筹学会第七届学术交流会论文集（下卷）[C];2004年

10 侯玲;刘杰;李鑫;丁镌;孙建华;赵国庆;;黑龙江地区蒙古族HLA-A、B、DRB1等位基因及单体型的研究[A];中国输血协会第五届输血大会论文专集（摘要篇）[C];2010年

中国重要报纸全文数据库 前5条

1 本报记者 李雪墨 李斌;单体型图破解人类基因组奥秘[N];医药经济报;2003年

2 ;科学家将合力绘制人类基因组遗传整合图中国卷[N];中国高新技术产业导报;2003年

3 张荔子 张清润;注释“天书”[N];健康报;2006年

4 张荔子;血样有助于破解遗传之谜[N];大众卫生报;2003年

5 本报记者　贾婧;寻找致病基因和群体遗传学研究的“金矿”[N];科技日报;2006年

中国博士学位论文全文数据库 前8条

1 汪颖;单体型和基因型问题的优化模型和算法[D];大连理工大学;2007年

2 王涛;中国人苯丙氨酸羟化酶基因突变的研究[D];中国协和医科大学;1994年

3 张永彪;中国6个民族群体HLA区域内TNF基因簇的核苷酸变异和单体型多态性[D];中国协和医科大学;2008年

4 武金才;肿瘤转移抑制基因HTPAP单体型与肝癌转移潜能的关系[D];复旦大学;2008年

5 梁晓慧;TERT、VEGF基因单核苷酸多态性及其单体型与新疆维吾尔族长寿的关联研究[D];新疆医科大学;2010年

6 余志杰;Tim-3基因多态性与湖北汉族人群AML的关联分析研究[D];华中科技大学;2014年

7 张强锋;单体分型和单体型频率估计[D];中国科学技术大学;2006年

8 谢民主;单体型组装问题参数化建模及算法研究[D];中南大学;2008年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 汤栩宁;基于单体型的致病基因区域发现算法研究[D];吉林大学;2008年

2 王彦坤;高通量测序检测榕小蜂COI基因异质性及其对分子鉴定的影响[D];河北大学;2015年

3 解惠坚;PPARα/δ/γ单核苷酸多态性及交互作用与脂蛋白(a)的关联研究[D];苏州大学;2015年

4 海波;过氧化物酶体增殖物激活受体α/γ单核苷酸多态性与TG/HDL-C比值、LDL-C/HDL-C比值的相关性研究[D];苏州大学;2015年

5 王兆灿;K单体型重建算法的研究[D];广西师范大学;2014年

6 罗锋;基于图论的单体型重建算法设计和可视化实验平台的构建[D];湖南师范大学;2014年

7 杨洋;单体型组装问题枚举算法研究[D];湖南师范大学;2014年

8 梁彬彬;个体单体型检测问题的研究[D];广西师范大学;2013年

9 齐漫龙;β1-肾上腺素能受体基因单体型与原发性高血压关联分析及功能鉴定[D];中国医科大学;2007年

10 覃慧卷;SP-A2单体型与早产儿呼吸窘迫综合征的相关性研究[D];广西医科大学;2015年

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本文编号：632552