发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒核衣壳蛋白优势线性B细胞抗原决定簇的预测与确定

发布时间：2017-09-02 21:15

  本文关键词：发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒核衣壳蛋白优势线性B细胞抗原决定簇的预测与确定

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【摘要】：为了确定发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒(Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus,SFTSV)核衣壳蛋白(N蛋白)的优势线性B细胞抗原决定簇位点,本文根据线性B细胞抗原表位拥有较强的抗原性、亲水性以及表面性等特点,运用生物信息学软件分析SFTSV N蛋白的氨基酸序列,预测潜在的线性B细胞抗原决定簇位点。根据已解析的SFTSV N蛋白晶体结构,使用PyMOL软件分析预测出的线性B细胞抗原决定簇位点的柔性及其在整个SFTSV N蛋白中的分布情况。人工合成相应多肽片段并以其为抗原,与SFTSV临床感染者的血清反应,采用多肽-酶联免疫吸附检测法检验多肽片段的免疫原性。结果共预测出六个可能的线性B细胞抗原决定簇位点,即A(40-KKLKETGGDDWVKDTK-55)、B(71-ASGKMSNSGSKRL-83)、C(94-ERAETRL-100)、D(135-LKVENYPP-142)、E(157-GVSEATT-163)和F(184-KMRGASKTEVYNSFRDP-200),均位于N蛋白表面且含有柔性较大的loop区。相应的六段人工合成多肽都与SFTSV临床病例血清呈阳性反应,确定它们均为优势线性B细胞抗原决定簇位点,其各自检测结果与商品化N蛋白抗体检测试剂盒相应检测结果进行线性回归分析表明呈正相关。综合运用上述多种方法,本研究成功地预测并确定了SFTSV N蛋白的线性B细胞抗原决定簇位点,为该病毒抗原特异性的分子基础研究以及相关疾病的诊断和治疗奠定了基础。
【作者单位】： 浙江省医学科学院病毒病研究所;宁波市疾病预防控制中心病毒研究所;
【关键词】： 发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒(SFTSV) 核衣壳蛋白(N蛋白) 线性B细胞抗原决定簇 多肽-酶联免疫吸附检测
【基金】：浙江省医药卫生平台重点资助计划项目(项目号:2013ZDA006) 浙江省重点实验室科技计划项目(项目号:2008F3022)
【分类号】：R373
【正文快照】： 发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒(SFTSV)是布尼亚病毒科白蛉病毒属的一种新病毒,主要由蜱虫叮咬传播。近年来,在辽宁、湖北、山东、河南、江苏、安徽、浙江等地均出现感染发热伴血小板减少综合征病毒的病例,患者临床上表现为起热急、乏力、恶心、呕吐等症状,伴有血小板减少

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本文编号：780927