一株柯萨奇病毒A9分离株的VP1基因遗传特征分析

发布时间：2017-09-13 07:41

  本文关键词：一株柯萨奇病毒A9分离株的VP1基因遗传特征分析

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【摘要】：目的分析引起病毒性脑炎(viral encephalitis,VE)的一株柯萨奇病毒(Coxsackievirus,CV)A9分离株(CVA9)的VP1基因遗传特征。方法采用KMB17细胞对VE患儿粪便标本进行病毒分离,利用RT-PCR法从分离的病毒中扩增VP1全基因,并测序,采用Mega 6.1和Geneious 5.6.5等软件分析其序列,并构建系统进化树。结果从5份VE患儿粪便中分离到一株人CVA9,命名为A108/YN/CHN/2009,其全长VP1基因的核苷酸长度与其他CVA9一致,均为906 bp。与中国其他分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为88.4%~98.2%和96.4%~99.3%,而与国外分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为81.0%~96.0%和92.7%~99.0%。在进化树上与其他中国分离株属同一分支中不同两个亚分支,与JB141230009亲缘关系较近。结论 A108/YN/CHN/2009分离株为肠道病毒CVA9血清型,与其他中国分离株同属一个基因簇。
【作者单位】： 中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室;
【关键词】： 柯萨奇病毒A VP基因 遗传特征
【基金】：云南省应用基础研究项目(2013FZ136)
【分类号】：R373.23;Q75
【正文快照】： 柯萨奇病毒A(Coxsackievirus A,CVA)属于小RNA病毒科(Picornaviridae)肠道病毒属(Enterovirus)。CVA可引起手足口病、无菌性脑炎、麻痹、肝炎、心肌炎和出疹等病症[1]。CVA的衣壳由VP1~VP4结构蛋白组成,而VP1与其分型相一致,已作为其遗传特征分析的对象[2]。CVA9虽为CVA,但其

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