eSNPdb,人类增强子区域单核酸多态性数据库

发布时间：2017-09-16 16:37

  本文关键词：eSNPdb,人类增强子区域单核酸多态性数据库

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【摘要】：增强子控制着多能性相关基因的转录,在细胞分化中起重要作用。数以千计的GWAS研究结果表明,一定数量疾病相关的SNP位于增强子区域,且近来的研究发现SNP通过影响增强子的功能引起对疾病的易感性,因此有必要对增强子区域的SNP进行整合和分析。我们建立了e SNPdb数据库,收集了增强子注释、SNP以及相关GWAS数据,将疾病与增强子建立联系。数据库收集了67 268个增强子,在这些区域上有826 350个SNP,其中8 521个与疾病相关。数据库还收集了位于增强子区域的转录因子结合位点信息,以便预测SNP对增强子区域转录因子的结合亲和性的影响。作为目前唯一收集增强子区域SNP信息的数据库,e SNPdb将会是研究增强子在人类疾病中的作用与机制重要的数据资源。
【作者单位】： 上海交通大学系统生物医学研究院;上海交通大学生物医学工程学院;
【关键词】： 增强子 单核酸多态性 GWAS 转录因子结合位点 疾病
【基金】：国家自然科学基金(31501054)资助
【分类号】：Q811.4;R394
【正文快照】： e SNPdb,a Database of SNPs in Human Enhancer RegionsZhang Ningbo1Cheng Ming2Bai Ling2Kang Yani2Li Hua2*1 Shanghai Center for Systems Biomedicine,Shanghai Jiao Tong University,Shanghai,200240;2 School of Biomedical Engineering,Shanghai JiaoTong University

【相似文献】

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1 辛忠涛,李君文,王新为,刘玮,初广运;氯对甲型肝炎病毒抗原性及核酸多态性影响的研究[J];卫生研究;2002年01期

2 ;[J];;年期

，

本文编号：864211