结核分枝杆菌潜伏感染相关蛋白Rv2004c的抗原表位预测

发布时间：2017-09-21 21:40

  本文关键词：结核分枝杆菌潜伏感染相关蛋白Rv2004c的抗原表位预测

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【摘要】：本文应用生物信息学技术预测结核分枝杆菌潜伏感染相关蛋白Rv2004c的抗原表位,为结核病的诊断和疫苗研发筛选合适的抗原靶位。通过Blast分析发现Rv2004c蛋白与人类蛋白的同源性较低;采用DNAStar软件包中的Protean软件分析其二级结构、亲水性、抗原性、柔韧性及表面可能性,预测该蛋白有10个候选B细胞抗原表位;应用RANKPEP及SYFPEITHI法预测该蛋白有37个候选Th细胞抗原表位,主要位于第200位氨基酸之后,其中HLA-DRB1*0401及HLA-DRB1*0701表型相对的表位数目较多且某些候选表位的主要组织相容性复合体(MHC)限制类型存在交叉重叠;应用SYFPEITHI法、BIMAS法及NetCTL法预测该蛋白有10个候选细胞毒性T淋巴细胞(CTL)表位,其中以HLA-A2限制性表位数目较多、分值较高。由此得出结论:Rv2004c蛋白含有较多潜在的T细胞和B细胞抗原表位,可作为新的结核病诊断试剂和疫苗研发的候选靶蛋白。
【作者单位】： 河北北方学院;解放军第三O九医院全军结核病研究所全军结核病防治重点实验室/结核病诊疗新技术北京市重点实验室;
【关键词】： 结核分枝杆菌 Rvc 表位预测 生物信息学
【基金】：国家重大传染病防治科技重大专项基金资助项目(2012ZX10003008002) 军队医学科技“十二五”重点资助项目(BWS11J050) 北京市科技创新基地培育与发展工程专项资助项目(Z141107004414021)
【分类号】：R378.911
【正文快照】： 引言结核病是全世界范围内危害人类健康的主要传染性疾病之一,是全世界由单一致病菌导致死亡最多的疾病,每年约导致150万人死亡和超过900万的新发结核病病例[1]。据世界卫生组织统计,全世界约有1/3的人感染过结核分枝杆菌,大多数呈潜伏感染状态,潜伏感染者如不进行治疗,有5%~1

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本文编号：897059