Fkbp51基因敲除小鼠肝脏与大脑海马区RNA表达谱系的分析比较

发布时间：2017-10-01 07:58

  本文关键词：Fkbp51基因敲除小鼠肝脏与大脑海马区RNA表达谱系的分析比较

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【摘要】：目的通过分析野生型小鼠(WT)与Fkbp51基因敲除(KO)小鼠肝脏、海马RNA表达谱系之间的差异,研究Fkbp51基因在代谢通路和神经通路中的作用。方法利用第二代测序技术对Fkbp51KO与WT小鼠的肝脏与海马mRNA进行表达谱测序,将测序结果用BRB-Array Tools进行分析,筛选出小鼠肝脏与海马的差异基因,然后分别利用在线工具DAVID对差异基因进行GO本体分析,STRING数据库对其进行蛋白质的相互作用网络分析,并利用Genecard对基因进行注释。结果 (1)Fkbp51的缺失,在肝脏中造成类固醇生物合成及代谢、脂类物质代谢以及氧化还原反应等相关基因表达水平的变化;(2)在海马中造成机械刺激探测、学习或记忆、突触传递的调节、PPAR信号通路、肌萎缩性脊髓侧索硬化症(ALS)等相关基因表达水平的变化;(3)在肝脏与海马中,Fkbp51的缺失同时造成了11个基因的共差异表达,这11个基因的蛋白网络互作图显示:HMGCS2与INSIG1及相关蛋白形成网络,而USP2与PER、CRY、DBP等相关蛋白形成另一个网络。这两个网络既参与代谢也参与神经调节。结论Fkbp51在代谢与神经中的作用既是相互独立又是相互联系的。
【作者单位】： 中国医学科学院医学实验动物研究所北京协和医学院比较医学中心卫生部人类疾病比较医学重点实验室国家中医药管理局人类疾病动物模型三级实验室;
【关键词】： Fkbp基因敲除小鼠 肝脏 神经系统 RNA-seq
【基金】：国家自然科学基金(81272273) 协和青年基金和中央高校基本科研业务费专项资金资助(333320140151;3332015054;3320140086) 中国医学科学院医学实验动物研究所基本科研业务费专项资助(DWS201508)
【分类号】：R3416
【正文快照】： Genecard programs,the Gene Ontology,the Protein-protein Interaction Network and the Gene Annotation were applied toidentify significant functional-relevant pathways.Results When compared differentially expressed genes betweenFkbp51KO and WT in liver,we f

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本文编号：952254