广东省肇庆市2014—2015年登革病毒分子分型及初步溯源研究
本文关键词:广东省肇庆市2014—2015年登革病毒分子分型及初步溯源研究
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【摘要】:目的了解广东省肇庆市2014-2015年登革病毒(DENV)的基因型别和可能的输入来源。方法收集登革热临床诊断病例急性期血清,对实时荧光反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测阳性标本进行病毒培养,分离株进行E基因扩增与序列测定,用Mega 5.1软件进行分子分型和系统进化树构建。结果 409份样品中147份实时荧光RT-PCR检测阳性(35.94%),其中2014年阳性144份(39.99%),以DENV 1(139/361)为主;2015年阳性3份(6.25%),以DENV 3(2/48)为主。共获得22株DENV分离株,其中20株为2014年DENV 1型的genotypeⅠ和Ⅲ,与2013-2014年广州、佛山市分离株核苷酸同源性分别为99.40%~100.00%和99.20%~100.00%,与新加坡、泰国、马来西亚和印度尼西亚分离株亲缘关系次之;2株为2015年DENV 3的genotypeⅢ,与近年新加坡和印度尼西亚分离株的核苷酸同源性为98.20%~99.70%。结论广东省肇庆市2014年暴发流行的DENV 1为genotypeⅠ和Ⅲ,可能由广州市和佛山市输入,2015年散发的DENV 3为genotypeⅢ,由佛山市输入,疫情毒株可能源于新加坡、印度尼西亚等东南亚流行株。
【作者单位】: 肇庆市疾病预防控制中心;
【关键词】: 登革病毒 E基因 实时荧光RT-PCR 序列分析
【分类号】:R373.33
【正文快照】: 登革病毒(dengue virus,DENV)属于黄病毒科(Flaviviridae)黄病毒属(Flavivirus),主要通过埃及伊蚊或白纹伊蚊叮咬传播[1]。近年来,由于全球气候变暖、生态环境改变、人口贸易跨境交往日益频繁等因素,加剧了DENV的扩散,估计有128个国家或地区约3.9亿人口受感染,成为全球关注的
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,本文编号:953468
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