长链非编码RNA在慢性阻塞性肺病中的变化
本文关键词:长链非编码RNA在慢性阻塞性肺病中的变化,,由笔耕文化传播整理发布。
《南京医科大学》 2014年
长链非编码RNA在慢性阻塞性肺病中的变化
毕辉
【摘要】:第一部分长链非编码RNA在慢性阻塞性肺病(COPD)中的变化 目的:长链非编码RNA(1ncRNA)参与了多种生理病理过程,研究证实其参与调控人类的多种疾病的病理机制。本篇研究通过基因芯片检测,研究报道lncRNA和mRNA在COPD病人(5例)、健康吸烟人群(5例)以及健康不吸烟人群(3例)中的表达差异变化。 方法:从人肺组织中提取RNA,使用Agilent Human lncRNA+mRNA Arrayv2.0系统进行基因分析,并与Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)数据库进行比对进行基因富集性分析(GO)以及信号通路分析。 结果:我们发现39,253条不同的lncRNA转录本表达于肺组织。与健康非吸烟人群相比,健康吸烟组中,87条lnCRNAs显著上升244条显著下降,并具有统计学差异,其上升和下降最明显的分别为:RNA50010|UCSC-9199-1005(13.02297倍);RNA58351|CombinedLit_316-550(12.609704倍).相反的,与健康吸烟人群相比,COPD组中,120条lncRNAs显著上升43条显著下降,并具有统计学差异,其上升和下降最明显的分别为:RNA44121UCSC-2000-3182(8.721127倍);RNA43510|UCSC-1260-3754(:5.527549倍).GO和信号通路分析提示吸烟参与了代谢信号通路的活化,造血干细胞以及代谢和免疫系统参与了COPD的发生发展。 结论:我们首次通过基因芯片技术研究报道ncRNAs在人肺组织中的表达情况。结果显示吸烟以及COPD疾病可以改变lncRNAs的表达,而这些差异表达lncRNAs有可能参与COPD形成和发展过程中的某些信号通路的调节,如中间代谢过程以及免疫机制。 第二部分长链非编码RNA—ENST00000548657在人支气管上皮细胞中的抗炎作用 目的:探讨长链非编码RNA—ENST00000548657对人支气管上皮细胞(HBE)炎症表达因子IL-6,IL-8表达的影响。 方法:体外培养人支气管上皮细胞,建立香烟提取物(CSE)刺激模型;建立基因ENST00000548657的细胞siRNA干扰模型;观察加入CSE及siRNA后的HBE细胞内IL-6和IL-9表达量变化; 结果:CSE可明显促进HBE细胞IL-6和IL-8的表达,siRNA干扰ENST00000548657基因后HBE细胞IL-6和IL-8的表达均下降。上述CSE的作用可部分被siRNA所拮抗。 结论:长链非编码RNA-ENST00000548657参与了炎症因子的表达调控,其可能参与COPD的发病机制。
【关键词】:
【学位授予单位】:南京医科大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2014
【分类号】:R563.9
【目录】:
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