游离二氧化硅所致肺成纤维细胞转分化过程中DNA甲基化差异基因的MeDIP-seq检测

发布时间：2018-08-02 18:15

【摘要】：目的:检测游离二氧化硅所致肺成纤维细胞转分化过程中可能存在的DNA甲基化差异基因并探讨其可能作用机制。方法:原代培养肺成纤维细胞和肺泡巨噬细胞,建立共培养的矽肺体外模型,采用甲基化DNA免疫共沉淀测序技术检测分析不同染毒时间(0、24、48 h)的肺成纤维细胞之间的DNA甲基化差异基因,并采用DAVID工具对检测到的甲基化差异基因进行KEGG的通路富集分析。结果:共发现8 791个基因的DNA甲基化程度在3个染毒时间组中均存在差异,DAVID工具分析发现这些差异主要集中在代谢、环境信息过程、细胞过程、生物体系统、人类疾病相关通路等通路中。结论:矽肺形成过程中存在大量DNA甲基化程度发生改变的基因,且这些基因涉及多个通路。
[Abstract]:Aim: to detect the differential gene of DNA methylation in lung fibroblast transdifferentiation induced by free silica and to explore its possible mechanism. Methods: pulmonary fibroblasts and alveolar macrophages were cultured in vitro. Methylated DNA immunoprecipitation sequencing technique was used to detect and analyze the differential DNA methylation genes among lung fibroblasts exposed to different exposure time (024 ~ 48 h), and DAVID tools were used to analyze the KEGG pathway enrichment of the detected differentially methylated genes. Results: a total of 8 791 genes were found to have different DNA methylation levels in the three exposure time groups. The results showed that these differences were mainly in metabolism, environmental information process, cellular process and biological system. Human disease related pathways and other pathways. Conclusion: there are a large number of DNA methylation genes involved in multiple pathways during silicosis formation.
【作者单位】： 郑州大学公共卫生学院劳动卫生学教研室;
【基金】：国家自然科学基金资助项目81102109;81472954
【分类号】：R135.2

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