Mucin 5B启动子区多态性变异与中国人群间质性肺炎发病风险的研究

发布时间：2017-03-16 22:04

  本文关键词：Mucin 5B启动子区多态性变异与中国人群间质性肺炎发病风险的研究，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：研究背景和目的MUC5B启动子区GT的变异,SNP (rs35705950)被证实与高加索人群中家族性肺间质病(familial interstitial pneumonia, FIP)和特发性肺纤维化(idiopathic pulmonary fibrosis, IPF)有强烈的关联性,但是该变异与中国人群发病风险的关系尚未见报道。本实验着手于MUC5B启动子区变异和中国人群间质性肺炎的发病风险的相关性进行研究。材料和方法1.利用限制性内切酶片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism, RFLP)方法筛查405例间质性肺疾病(interstitial lung diseases, ILD)病人、360例自身免疫病病人、103例普通肺炎病人和2034例正常对照人的DNA样本中MUC5B基因启动子区GT多态性变异(rs35705950)的基因型。2. Taqman探针法筛查ILD病人、自身免疫病病人、普通肺炎病人和正常对照人群DNA样本中MUC5B基因动子区GT多态性变异(rs35705950)的基因型。3.直接测序法确定筛查出的杂合型(G/T)样本的多态性位点基因型。结果1. MUC5B基因启动子区GT变异：健康对照中T等位基因频率为0.66%,ILD病人中T等位基因频率为2.22%,IPF病人中T等位基因频率为3.33%,自身免疫病病人和普通肺炎病人中T等位基因频率分别为0.7%和0.49%。2.中国正常人群中MUC5B启动子区突变T等位基因频率显著低于高加索人群(0.66%比10%),且T等位基因在中国正常人群中存在性别分布上的差异,T等位基因在成年男性(≥30岁)中的等位基因频率低于成年女性(0.42%比1.04%,P=0.030),而在年轻男性(30岁)和女性中则没有显著差别。3.病例-对照研究发现,ILD病人MUC5B基因启动子区GT多态性变异的等位基因频率为2.22%,显著高于正常对照组0.79%(P=0.002,OR:2.885；95%CI: 1.449-5.627):IPF病人中T等位基因频率3.33%,与健康对照组有显著差异(P =0.001,OR:4.332,95%CI:1.992-9.419).按照年龄性别分层分析表明,MUC5B的这一多态性变异与ILD和IPF发病风险的相关性主要表现在老年(≥55)男性人群(OR:8.152,95%CI:2.192-30.314；OR:10.481,95％CI:2.593-42.355)。而在自身免疫病和普通肺炎病人中,MUC5B基因启动子区GT多态性变异频率与对照中相比无显著性差异,表明与其发病风险无明显关联。结论我们在筛查MUC5B基因启动子区GT变异(rs35705950)与ILD发病风险关系时,发现中国人群中T等位基因频率显著低于欧洲高加索人群。尽管该突变不是中国人群患IPF的主要因素,但是也与中国人ILD/IPF病人有强发病风险。未发现MUC5B基因rs35705950多态性与CTD-ILD.自身免疫病、普通肺炎有发病风险相关性。
【关键词】：MUC5B基因 多态性变异 间质性肺炎 特发性肺纤维化 发病风险
【学位授予单位】：南京大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2014
【分类号】：R563.1
【目录】：

• 中文摘要6-8
• ABSTRACT8-10
• 英文缩写与中文对照10-11
• 1. 研究背景11-13
• 2. 材料与方法13-26
• 2.1 研究对象13-15
• 2.2 主要仪器和试剂15-16
• 2.3 外周血DNA提取16-17
• 2.4 MUC5B基因启动子区rs35705950多态性变异的筛查17-22
• 2.4.1 引物设计17
• 2.4.2 限制性片段长度多态性技术分析MUC5B基因启动子区变异的基因型17-19
• 2.4.3 Taqman探针法筛查MUC5B基因启动子区突变19-22
• 2.5 高分辨率溶解曲线分析MUC5B启动子区rs17235353缺失/插入的变异分析22-24
• 2.6 MUC5B基因测序24-26
• 2.6.1 琼脂糖凝胶回收PCR产物24-25
• 2.6.2 Bigdye反应25
• 2.6.3 沉淀步骤25-26
• 2.6.4 测序26
• 2.7 统计学方法26
• 3. 实验结果26-37
• 3.1 MUC5B基因启动子区多态性变异(rs35705950)筛查和验证26-30
• 3.2 中国人群中rs35705950 T等位基因频率低,成年男性和成年女性中有很大差异30-32
• 3.3 病例对照分析表明rs35705950 T等位基因与中国人群ILD和IPF风险相关32
• 3.4 MUC5B rs35705950多态性与结缔组织病相关的ILD发病风险无明显关联32
• 3.5 分层分析MUC5B多态性并以与ILD的风险相关性32-34
• 3.6 MUC5B启动子区的突变rs17235353与IPF的风险相关性34-37
• 4. 讨论37-40
• 5. 结论40
• 参考文献40-45
• 综述45-58
• 参考文献52-58
• 硕士期间发表论文58-59
• 致谢59-60

【共引文献】

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本文编号：252375