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ORMDL3基因rs7216389位点多态性与哮喘相关性研究

发布时间:2020-04-15 01:47
【摘要】:目的:检测ORMDL3基因rs7216389位点多态性在中国江西地区汉族人群中的分布频率,探讨rs7216389位点多态性与支气管哮喘的关系。 方法:试验分二组:(1)哮喘组:哮喘病例患者80例,其中男性43例,女性37例;(2)对照组:同期的健康体检患者84例作为对照组,其中男性46例,女性38例。应用DNA提取试剂盒提取基因组DNA。采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)检测ORMDL3的基因型。将我国江西地区汉族人群与其他不同种族人群间的ORMDL3基因rs7216389位点等位基因频率进行了比较;还比较了两组之间各基因型及等位基因的分布频率。 结果:(1)哮喘组和对照组ORMDL3基因rs7216389位点3种基因型(TT、TC、CC)分布频数分别为30、36、14和18、40、26;采用χ2检验对不同基因型的分布观察值和期望值进行比较(哮喘组χ2=0.108;对照组χ2=0.097,P均0.05),差异均无统计学意义;(2)健康对照组ORMDL3基因rs7216389位点等位基因频率在不同种族人群中比较差异有显著性差异(χ2=19.31,P0.05);(3)在哮喘组ORMDL3基因rs7216389位点等位基因T与C的分布频率分别为60.0%和40.0%,在对照组为45.2%和54.8%,两组T与C等位基因频率差异比较亦有统计学意义(χ2=7.16,P0.05);哮喘组中ORMDL3基因rs7216389位点3种基因型(TT、TC、CC)分布频率分别为37.5%、45.0%、17.5%;健康对照组分布频率分别为21.4%、47.6%、31.0%,3种基因型在两组分布频率差异比较有统计学意义(χ2=6.72,P0.05);(4)对ORMDL3基因rs7216389位点基因多态性与哮喘相关性进行单变量Logistic回归分析,结果表明相对CC基因型而言,TT+TC与TT基因型均能显著增加哮喘发生的概率[优势比(OR)值及95%可信区间(CI)分别为2.113(1.009-4.426)、3.095(1.292-7.417),P均0.05]。 结论:(1)ORMDL3基因rs7216389位点多态性广泛存在于不同地域及种群中,包括江西地区汉族人群,且分布频率差异有显著性。(2)ORMDL3基因rs7216389位点多态性与江西地区汉族人群哮喘易感性相关,其T等位基因是哮喘病的易感基因。
【图文】:

产物,退火温度,基因,反应体系


图1ORMDL3基因在不同退火温度下PCR产物检测l泳道:DNAMarke几2泳道:55oCpCR产物,3泳道:56oCPeR产物,4泳道:57℃PCR产物,5泳道:58oCPCR产物PCR扩增产物电泳鉴定:取5川扩增产物,在2.5%的琼脂糖凝胶ldViewnal核酸染料)上电泳,电压105V约40min,利用凝胶成像分进行分析、拍照,测得各组条带的平均灰度值,重复3次,以ORMD度值作为表达结果。ORMDL3基因条带扩增片段大小为2llbP。4.3限制性酶内切分析NSII酶切反应体系20ul,去离子水巧.oul一10xNEB缓冲液2.oulR产物2.oul*点动*限制性内切酶Nsill.oul(酶切反应体系见表置于37℃恒温水浴箱中消化3h*80℃失活20min*3.5%琼脂糖证。表2.3Nsil酶切反应体系体积(ul)PCR产物(DNA)

电泳图,产物,琼脂糖凝胶电泳,基因


CR反应产物及酶切产物结果判定R反应产物片段长度为21lbP,,酶切后电泳图见图2。在21lb为野生型CC型,在145bP、66bp处出现亮带者为纯合子T、145bP和66bP处出现亮带者为杂合子TC型。
【学位授予单位】:南昌大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2011
【分类号】:R562.25

【共引文献】

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本文编号:2627983

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