IL-17基因多态性及其位点间交互作用与尘肺易感性相关性研究

发布时间：2017-04-16 08:12

  本文关键词：IL-17基因多态性及其位点间交互作用与尘肺易感性相关性研究，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：目的本次研究采用成组的病例对照研究方法,通过对中国汉族人群尘肺病例组及对照组IL-17A的rs2275913、rs4711998和IL-17F rs763780多态位点基因型的分析探讨IL-17基因3个位点基因型与尘肺易感性的关系。另外结合3个位点的基因型的分析结果对IL-17基因位点间进行连锁不平衡分析和单体型分析,研究构建出的单体型与尘肺的易感性是否存在关联,最后对基因位点之间的交互作用进行初步研究。方法采用聚合酶链反应-限制性片断长度多态性(PCR-RFLP)方法对219例尘肺病患者及242例对照者进行IL-17基因的基因型检测。Excel 2003建立数据库,应用SPSS 17.0统计软件进行相关数据处理及统计分析,应用在线SHEsis软件进行各个位点的连锁不平衡分析和单体型分析。多因子降维法(MDR)分析基因位点之间交互作用。结果所检测的的3个基因位点在对照组的基因型频率分布均符合哈迪-温伯格平衡(P0.5),说明所选样本具有群体代表性。尘肺病例组和对照组在年龄、吸烟率、累积接尘工龄和工种的差异均无统计学意义(P0.5)。IL-17A的rs2275913位点经酶切以后分为AA、AG和GG基因型,它们在尘肺病例组中的基因频率分别为30.1%、53.9%和16.0%,在对照组的基因分布频率依次为31.0%、47.9%和21.1%,三种基因型频率在两组中的分布差异没有统计学意义(P0.05)。IL-17A的rs4711998位点分为AA、AG和GG基因型,它们在尘肺病例组中的基因频率依次为46.1%、47.0%和6.9%,在对照组的基因分布频率依次为47.9%、45.1%和7.0%,三种基因型在两组中的分布差异无统计学意义(P0.05)。IL-17F的rs763780位点AA、AG和GG基因型在病例组的基因频率分别为79.0%、20.5%和0.5%,在对照组的基因型分布频率分别为67.8%、38.1%和0.4%,经统计学检验后,三种基因型在两组中的分布差异有统计学意义(P0.05),等位基因A和G在病例组中的分布频率是89.3%和10.7%,在对照组中的等位基因分布频率为83.7%和16.3%,差异具有统计学意义。经连锁不平衡检验,IL-17A的rs2275913、rs4711998和IL-17F基因rs763780的3个基因位点两两之间均不存在连锁不平衡(D’0.7,r 20.3),对3个基因位点进行单体型分析共构建8种单体型,其中G A G单体型在尘肺病例组和其对照组中的频率分布的差异具有统计学意义(P0.5),所构建的其他单体型与尘肺易感性无显著关联(P0.5)。应用MDR方法分析IL-17A和IL-17F基因的3个位点的交互作用,结果显示三个模型均无统计学意义(P0.5),说明这3个基因位点相互之间不存在交互作用。结论1本次研究发现IL-17A基因的rs2275913和rs4711998位点基因多态性与尘肺易感性无关。2 IL-17F基因rs763780位点基因多态性与尘肺易感性有关,AG基因型是尘肺的保护基因型,且G等位基因是尘肺的保护等位基因型。3本次研究发现rs2275913、rs4711998和rs763780位点之间连锁平衡,GAG单体型是尘肺病的保护因素。rs2275913位点的G等位基因和rs4711998位点的A等位基因会增加rs763780位点G等位基因对尘肺发病的保护效力。4所研究的rs2275913、rs4711998和rs763780位点相互之间不存在交互作用。
【关键词】：尘肺 IL-17 基因多态性 多因子降维法 交互作用
【学位授予单位】：华北理工大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R135.2
【目录】：

• 摘要4-6
• Abstract6-10
• 英文缩略表10-11
• 引言11-14
• 第1章 实验研究14-38
• 1.1 对象与方法14-22
• 1.1.1 SNP位点的选择14
• 1.1.2 研究对象的样本量14-15
• 1.1.3 研究对象的选择15
• 1.1.4 实验仪器和所用试剂15-17
• 1.1.5 MDR软件包使用17-18
• 1.1.6 研究内容18-21
• 1.1.7 统计分析21
• 1.1.8 质量控制21-22
• 1.2 结果22-31
• 1.2.1 基本情况22-23
• 1.2.2 影响尘肺发病主要因素23-25
• 1.2.3 Hardy-Weinberg检验25
• 1.2.4 IL-17A和IL-17F的多态位点基因分型电泳图25-27
• 1.2.5 IL-17A和IL-17F基因位点基因型及等位基因分布情况27-28
• 1.2.6 连锁不平衡和单体型分析28-30
• 1.2.7 IL-17A和IL-17F基因位点交互作用分析30-31
• 1.3 讨论31-34
• 1.4 小结34
• 参考文献34-38
• 第2章 综述38-47
• 2.1 IL-17的一般情况38-40
• 2.1.1 IL-17的结构38
• 2.1.2 IL-17的来源38-39
• 2.1.3 IL-17的生物学效应39-40
• 2.2 IL-17基因多态性的研究40-41
• 2.3 IL-17与器官纤维化41-42
• 2.3.1 IL-17与肺纤维化41
• 2.3.2 IL-17与肝纤维化41-42
• 2.3.3 IL-17与其他器官纤维化42
• 2.4 总结42
• 参考文献42-47
• 结论47-48
• 附录A 接尘工人调查表48-49
• 附录B 知情同意书49-51
• 附录C 伦理认证报告51-52
• 致谢52-53
• 导师简介53-54
• 作者简介54-55
• 学位论文数据集55

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 施沛青;朱书;钱友存;;IL-17的信号传导及功能研究[J];中国细胞生物学学报;2011年04期

  本文关键词：IL-17基因多态性及其位点间交互作用与尘肺易感性相关性研究，，由笔耕文化传播整理发布。

本文编号：310383