环介导等温扩增技术在重症社区获得性肺炎病原学诊断中的临床意义研究

发布时间：2017-07-14 16:27

  本文关键词：环介导等温扩增技术在重症社区获得性肺炎病原学诊断中的临床意义研究

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【摘要】：背景：由于缺乏有效的诊断方法,重症社区获得性肺炎(Severe Community-acquired Pneumonia,sCAP)的病原学诊断率低,致患者不能在早期获得针对性治疗。环介导等温扩增(Loop-mediated Isothermal Amplification, LAMP)作为一种新的核酸扩增技术,具有操作简便、对实验条件要求低以及反应时间短等特点,适用于常见病原体的早期检测。目的：验证LAMP检测法诊断sCAP常见病原体的有效性和可行性。方法：研究对象为临床诊断sCAP患者,在入院当天收集痰或肺泡灌洗液检测,采用培养法和LAMP法检测12种常见病原体。以培养法作为标准检测法,研究LAMP法诊断sCAP病原学的灵敏度、特异度和准确度。结果：共纳入79例重症社区获得性肺炎患者中,其中28例(35.4%)经痰培养确定为阳性。以培养法作为标准法,LAMP法检测病原体DNA浓度对数所对应的ROC曲线中,当截断值取2.95时,曲线下面积(Area Under the Curve, AUC)最大为0.871(95%CI0.777-0.936,P0.05),灵敏度、特异度及其95%CI分别为96.4%(81.7-99.9)和68.6%(54.1-80.9)。LAMP法检测一致性为79.1%,灵敏度为96.4%,特异度为68.6%,阳性预测值为80.0%,阴性预测值为98.0%。28例标准法阳性组中,平均DNA浓度为(lg10 copies/ml)为(4.3±0.9)；51例标准法阴性组中,平均DNA浓度(lg10 copies/ml)为(2.5±1.6),两组患者DNA浓度差异有统计学意义(P0.05)。LAMP法检出率最高的5种病原体依次为铜绿假单胞菌、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌、鲍曼不动杆菌和嗜麦芽窄食单胞菌。LAMP法各病原体DNA浓度之和与PCT、白细胞行两两之间的Spearman相关分析,相关系数分别为0.73(95%CI0.60-0.82,P0.05)、0.42(95%CI0.21-0.59,P0.05)。结论：1.LAMP法能够作为一项检测sCAP患者常见病原体的手段。2.标准法阳性标本病原体DNA浓度明显高于标准法阴性标本。3.病原体DNA浓度之和与PCT、白细胞存在正相关。
【关键词】：环介导等温扩增 痰培养 重症社区获得性肺炎
【学位授予单位】：南昌大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R563.1;R440
【目录】：

• 摘要3-5
• ABSTRACT5-10
• 第1章 前言10-12
• 第2章 材料与方法12-17
• 2.1 研究对象12-13
• 2.1.1 病例来源12
• 2.1.2 入选标准12-13
• 2.1.3 排除标准13
• 2.2 实验材料及仪器设备13-14
• 2.3 实验方法14-16
• 2.3.1 支气管肺泡灌洗液采集方法14
• 2.3.2 痰标本采集方法14
• 2.3.3 标本的保存14
• 2.3.4 常规培养检测法14-15
• 2.3.5 LAMP法检测15-16
• 2.4 统计方法16-17
• 第3章 结果17-23
• 3.1 一般资料17
• 3.2 LAMP扩增结果17-20
• 3.2.1 LAMP扩增曲线17-18
• 3.2.2 LAMP结果分析南昌大学第一附属医院重症监护病房sCAP病原体流行病学18-19
• 3.2.3 培养法阴性与阳性标本DNA浓度19-20
• 3.3 不同诊断方法的有效性20
• 3.4 LAMP检测sCAP病原体的ROC曲线20-21
• 3.5 LAMP结果与PCT、白细胞的相关分析21-23
• 第4章 讨论23-26
• 第5章 结论与展望26-27
• 5.1 结论26
• 5.2 展望26-27
• 致谢27-28
• 参考文献28-31
• 综述 环介导等温扩增技术在肺部感染病原体检测中的作用31-37
• 参考文献36-37

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本文编号：541831