多位点序列分型方法在嗜麦芽窄食单胞菌分子分型中的应用

发布时间：2017-10-15 23:38

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【摘要】：目的建立多位点序列分型方法(Multilocus sequence typing,MLST)分析嗜麦芽窄食单胞菌。方法提取嗜麦芽窄食单胞菌基因组DNA,选择文献报道的7个嗜麦芽窄食单胞菌管家基因进行PCR扩增,将目的基因PCR产物测序,测序结果与标准序列比对后上传至数据库(http://pubmlst.org/smaltophilia/),获得相应的7对管家基因组成的等位基因谱和序列分型编码(sequence types,STs),应用MLST方法分析68株嗜麦芽窄食单胞菌ST型的流行病学意义。结果对68株嗜麦芽窄食单胞菌菌株通过多位点序列分型方法分析,所有菌株均为同一新的ST型(ST87),该结果与现场流行病学的关系一致。结论 MLST是一种方便、快速的分子生物学方法,实验室菌株资料可以比较,适用于嗜麦芽窄食单胞菌的进化关系、群体结构和长期的全球分子流行病学研究。
【作者单位】： 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所;
【关键词】： 嗜麦芽窄食单胞菌 分子分型 多位点序列分型
【基金】：国家科技重大项目“重大传染病应急处置检测技术平台”(No.2011ZX10004-001,No.2013ZX10004-101002)~~
【分类号】：R378.2
【正文快照】： 窄食单胞菌属(Stenotrophomonas)是一个新命名的菌属,属于变形菌门、β-γ变形菌亚纲,严格 非发酵型专性需氧、具有运动能力的革兰氏阴性杆菌,以前称为嗜麦芽假单胞菌和嗜麦芽窄食单胞菌。近几年除了嗜麦芽窄食单胞菌(S.maltophilia)外,还鉴定了以下11个种:好氧反硝化窄食单

【共引文献】

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