阜阳市手足口病柯萨奇病毒A10型VP4区基因特征分析

发布时间：2017-10-27 05:09

  本文关键词：阜阳市手足口病柯萨奇病毒A10型VP4区基因特征分析

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【摘要】：目的分析2011-2012年阜阳市手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)患儿咽拭子标本分离的柯萨奇病毒A10型(coxsackievirus A10,CoxA10)VP4区的基因特征,初步了解该病毒的变异情况。方法对49份HFMD患儿的咽拭子标本进行病毒分离,出现人肠道病毒(human enterovirus,HEV)特征性病毒致细胞病变效应(cytopathic effect,CPE)后提取病毒RNA,用VP4区分型引物进行半巢式反转录-PCR,再通过测序和GenBank Blast比对确定病毒型别,并对其VP4区进行序列进化分析。结果 49份咽拭子标本有16份出现了特征性CPE,病毒分离阳性率32.7%。其中三株经鉴定为CoxA10,阳性率18.8%。它们的VP4区核苷酸序列同源性为95%～99%,与GenBank中参考毒株VP4区核苷酸序列同源性为77%～97%。其中与中国株HQOO5431同源性为96%～97%,与中国株JN639887同源性为96%～97%,与中国株FJ598089同源性为95%～96%,与日本株AB282808同源性为85%～86%,与日本株AB162743同源性为87%～89%,与CoxA10原型株Kowalik(AF081300)同源性为77%～78%。进化分析表明这三株分离株与Kowalik株聚成一簇,均属于CoxA10,与日本各地分离的CoxA10的病毒核苷酸差异较大,但与我国本土分离株自成一簇。结论 2011-2012年阜阳地区手足口病病原体CoxA10 VP4与中国地区分离株在进化上密切相关,其序列未发生明显变异。
【作者单位】： 安徽医科大学基础医学院微生物学教研室;哥伦比亚大学病理与细胞生物学教研室;
【关键词】： 手足口病 柯萨奇病毒感染 序列同源性
【基金】：国家自然科学基金(30872253) 安徽省科技厅科技攻关项目(8010302179)
【分类号】：R373
【正文快照】： 作为一种常见的儿童传染性疾病,手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)近年来在我国的发病率呈现明显上升的趋势。HFMD主要由多种人肠道病毒(human enterovirus,HEV)引起,包括柯萨奇病毒A组(coxsackievirus A,CVA)的2、4、5、7、9、10、16型,柯萨奇病毒B组(coxsackievir

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本文编号：1102039