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EGF对hAMSCs基因表达谱影响及生物信息学分析

发布时间:2017-10-28 21:19

  本文关键词:EGF对hAMSCs基因表达谱影响及生物信息学分析


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【摘要】:目的探讨表皮生长因子(EGF)对人羊膜间充质干细胞(hAMSCs)基因表达谱影响及分子机制。方法采用基因表达谱测序(Illumina RNA-Seq)技术和生物信息学分析方法,对100 ng/mL EGF干预前后的hAMSCs基因表达测序比对,确定hAMSCs基因表达谱,RT-PCR检测进行验证。结果筛选出差异表达基因104个(FDR≤0.001和|log2Ratio|≥1),其中上调差异表达基因56个,下调差异表达基因48个;GO生物学过程富集分析26个生物学过程具有显著性差异(P≤0.05);KEGG信号通路富集分析细胞因子与细胞因子相互作用信号通路具有显著性差异(Q≤0.05),RT-PCR检测验证与基因表达谱结果一致。结论 EGF干预hAMSCs引起基因表达谱的变化,显著差异表达的基因和信号通路可能在hAMSCs增殖和迁移及促进创伤修复过程中具有重要作用。
【作者单位】: 中国医科大学
【关键词】表皮生长因子 人羊膜间充质干细胞 基因表达谱 测序 生物信息学
【基金】:国家重点基础研究发展规划(2012CB518103) 国家自然科学基金(81370883) 辽宁省科学技术计划(2012225080) 沈阳市科学技术计划(F11-262-9-01)
【分类号】:R329.28
【正文快照】: 表皮生长因子(epidermal growth factor,EGF)是细胞有丝分裂的刺激原,可以加快细胞分裂、促进增值、改变细胞的趋化性、增加细胞的迁移;应用EGF可以明显增加创面内胶原和细胞DNA含量,加速创面愈合[1],已在皮肤创伤和眼部等疾病的治疗中应用[2]。人羊膜间充质干细胞(human amni

【参考文献】

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本文编号:1110006

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