hsa-miR-1908靶基因预测及生物信息学分析

发布时间：2017-11-28 07:05

  本文关键词：hsa-miR-1908靶基因预测及生物信息学分析

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【摘要】：目的对hsa-miR-1908进行系统的生物信息学分析,预测其可能参与的生物学过程及信号通路,为深入研究其在人脂肪细胞分化、肥胖发生等过程中的功能与机制奠定基础。方法应用miRBase获取hsa-miR-1908的序列,并分析其特征;应用miRanda预测hsa-miR-1908的靶基因,并取预测结果及基因芯片结果的交集,进一步进行基因功能注释(Gene ontology)和生物通路富集分析(Pathway enrichment)。结果 hsa-miR-1908在各物种之间有一定保守性,其靶基因功能富集于Wnt受体信号的调控、细胞周期、细胞凋亡等生物学过程;其靶基因信号通路富集于促性腺激素释放激素信号通路、MAPK信号通路、胰岛素信号通路、细胞周期等信号转导通路及胰腺癌等疾病通路中。结论 hsa-miR-1908预测的靶基因集合富集于多个信号通路及生物学过程,与肥胖密切相关,为后续has-miR-1908在人脂肪细胞中生物学功能研究奠定基础。
【作者单位】： 南京医科大学儿科研究所;南京医科大学附属南京妇幼保健院儿童保健科;
【基金】：国家自然科学基金项目(No.81100618) 南京市科技计划项目(No.201104013)
【分类号】：R341
【正文快照】： microRNA(smiRNAs)是生物体内一类长度约22个核苷酸的内源性非编码单链小RNA,通过与其靶标mRNA3’UTR不完全互补配对、降解靶mRNA或抑制靶mRNA翻译(转录后调控作用)的机制来发挥其作用,调节几乎所有的生命活动(包括脂肪组织分化及发育)和大多数疾病的发病过程[1-5]。miR-1908

【共引文献】

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本文编号：1233102