线粒体融合基因2启动子的生物信息学研究

发布时间：2018-01-13 02:07

  本文关键词：线粒体融合基因2启动子的生物信息学研究　出处：《中国动脉硬化杂志》2013年02期 　论文类型：期刊论文

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【摘要】：目的线粒体融合基因2是一个新发现的负调控血管平滑肌细胞增殖的基因,在原发性高血压患者血管平滑肌细胞中低表达,但其调控机制还不明确。本研究通过生物信息学方法研究线粒体融合基因2的转录和调控机制。方法通过使用在线软件,对线粒体融合基因2上游5'端的启动子分布、转录因子及其结合位点、CpG岛、TATA box分析、保守区域等进行分析。同时对该区SNP的分布及其功能进行研究。结果线粒体融合基因2上游5'端存在5个启动子,但是起核心作用的可能只有2个;有2个保守区域,存在69个转录因子结合位点,后者主要与炎症反应、氧化应激、细胞增殖与分化和MAPK、STAT信号传导通路相关;一个CpG岛;15个TATA box,有8个处于-2000 bp以内;32个SNP位点,其中9个处于核心启动子区,5个可能会影响线粒体融合基因2的转录。结论线粒体融合基因2上游5'端-400 bp以内可能存在着核心启动子,该启动子区存在着一些重要的与线粒体融合基因2功能相关的转录因子。同时,启动子区存在的大量SNP可能会影响基因的转录调控。
[Abstract]:Objective To study the mechanism of transcription and regulation of mitochondrial fusion gene 2 , which is a newly discovered gene which regulates the proliferation of vascular smooth muscle cells . The mechanism of transcription and regulation of mitochondrial fusion gene 2 is studied by bioinformatics .

【作者单位】： 首都医科大学附属北京安贞医院北京市心肺血管疾病研究所高血压研究室;
【基金】：国家自然科学基金(81270216) 国家863高技术项目基金资助(2008AA02Z441) 北京市自然科学基金重大项目(7120001);北京市自然科学基金项目(7102045)
【分类号】：R346
【正文快照】： 血管平滑肌细胞(vascular smooth muscle cells,VSMC)的异常增殖是原发性高血压(essential hyper-tension,EH)动脉粥样硬化常见的原因,同时也是EH的常见结果,但是其潜在的分子机制还不清楚。1997年陈光慧等[1]从自发性高血压大鼠(spontaneouslyhypertensive rat,SHR)血管中分

【参考文献】

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【共引文献】

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【二级参考文献】

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