利用生物信息技术预测RhD蛋白质抗原活性表位
本文选题:RhD蛋白 + 抗原活性 ; 参考:《中国输血杂志》2013年10期
【摘要】:目的预测人RhD蛋白刺激B淋巴细胞产生相应抗体的抗原活性表位。方法利用生物信息技术及互联网平台,以TMHMM和TMpred预测蛋白跨膜区结构为基础,通过ABCpred和BepiPred方案初步筛选RhD蛋白抗原活性表位,并以Swiss-Model Workspace同源模建的RhD蛋白三级结构作抗原表位定位。结果预测人RhD蛋白的N端36~41、100~104、353~356区段为RhD抗原活性表位区域。结论上述结果可作为确定结果 RhD蛋白潜在优势表位的参考。
[Abstract]:Objective to predict the antigenic epitopes of B lymphocytes stimulated by human RhD protein.Methods using bioinformatics and Internet platform, based on TMHMM and TMpred to predict the transmembrane structure of proteins, the active epitopes of RhD proteins were preliminarily screened by ABCpred and BepiPred schemes.The tertiary structure of RhD protein constructed by Swiss-Model Workspace homologous model was used as antigen epitope localization.Results it was predicted that the N-terminal region of human RhD protein 3641100m 104353m656 was an active epitope of RhD antigen.Conclusion the above results can be used as a reference for determining the potential dominant epitopes of RhD protein.
【作者单位】: 深圳市血液中心;陕西省血液中心;广州中医药大学第二附属医院输血科;
【基金】:深圳市科技计划项目(医疗卫生类)重点项目(201201015)
【分类号】:R392
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本文编号:1746737
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