2009～2012年杭州地区甲型H1N1流感病毒HA与NA基因的进化分析

发布时间：2018-05-13 00:09

  本文选题：甲型HN流感病毒 + 血凝素　； 参考：《临床检验杂志》2013年04期

【摘要】：目的研究杭州地区2009年至2012年甲型H1N1流感病毒血凝素(HA)与神经氨酸酶(NA)的基因进化特征,分析该病毒的遗传变异和抗原的分子水平转变。方法用RT-PCR分别扩增甲型H1N1流感病毒HA基因和NA基因片段并进行测序,用DNAMAN和MEGA 4.0生物信息学软件对HA和NA基因序列进行进化分析。结果建立的RT-PCR可成功检测HA(C)、HA(D)和NA基因,遗传进化分析结果表明,杭州地区甲型H1N1流感病毒的HA与NA氨基酸序列的亲缘系数与WHO推荐的病毒株及国内代表株的同源性均为98.9%～100%;三维构象结果表明,HA编码的蛋白质有5个位点发生改变,而NA编码的蛋白质仅发生2个位点改变。结论 2009年至2011年杭州地区甲型H1N1流感病毒HA和NA基因序列与世界范围内流行的病毒参考株具有高度同源性,但HA与NA蛋白质表位存在某些氨基酸位点的改变。
[Abstract]:Objective to study the genetic evolution of hemagglutinin (HA) and neuraminidase (neuraminidase) of influenza A (H1N1) virus from 2009 to 2012 in Hangzhou, and to analyze the genetic variation and molecular level transformation of the virus. Methods the HA gene and na gene fragment of H1N1 influenza A virus were amplified by RT-PCR and sequenced. The sequences of HA and na genes were analyzed by DNAMAN and MEGA 4.0 bioinformatics software. Results the established RT-PCR could be successfully used to detect HAD and na genes, and the results of genetic evolution analysis showed that, The homology of HA and na amino acid sequence of influenza A (H1N1) virus in Hangzhou area was 98.9100.The result of 3D conformation showed that the protein encoded by HA changed at 5 sites. However, na encoded protein changed only 2 sites. Conclusion the sequences of HA and na genes of influenza A (H1N1) virus in Hangzhou from 2009 to 2011 are highly homologous to those of the worldwide viral reference strains, but there are some amino acid epitopes in HA and na protein epitopes.
【作者单位】： 浙江大学医学院附属义乌医院检验科;浙江大学医学院附属第一医院检验科;
【基金】：“十二五”国家科技重大专项(No:2012ZX10004-210) 浙江省教育厅(N20110467)
【分类号】：R373.14

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 汪力亚;抗人轮状病毒血凝素单克隆抗体的特性鉴定[J];细胞与分子免疫学杂志;1986年04期

2 余荣汉,沈宏开,姚益新,倪大石;安徽省两株流行性出血热病毒杂交瘤单克隆抗体性质的比较[J];生物学杂志;1987年01期

3 田国斌,唐秀英,于康震;禽流感病毒人工感染鸡抗体的监测及血凝素分型血清的制备[J];中国预防兽医学报;1998年01期

4 黄孝天;鼻内接种C3d融合的血凝素产生的抗流感病毒感染的保护作用[J];国外医学.预防.诊断.治疗用生物制品分册;2005年02期

5 周群山;;禽流感病毒的分子生物学研究进展[J];海峡药学;2006年05期

6 张晓春;龙冬玲;孟建彤;黄薇;黄韦唯;刘衡川;;成都市2009年流感病毒H3N2亚型血凝素基因分析[J];现代预防医学;2011年15期

7 夏东翔,汪美先,姜绍谆,马文煜,倪大石;肾综合征出血热病毒血凝活性的初步研究[J];第四军医大学学报;1985年03期

8 汪力亚,郑仁瑞,徐志凯,汪美先,姜绍谆;肾综合征出血热病毒血凝素单克隆抗体的研制与鉴定[J];细胞与分子免疫学杂志;1988年04期

9 严家新;黄鹤;潘南胜;姚洁;;用~(125)I标记肽图估计近年来流行的甲型流感病毒血凝素的变异率[J];中国病毒学;1992年02期

10 孙林;季琰;左为亮;王秀荣;潘志明;焦新安;;抗H9亚型禽流感病毒血凝素单克隆抗体的制备和鉴定[J];生物技术通讯;2010年01期

相关会议论文 前10条

1 尹惠琼;刘松婷;史利军;杨姝;章金刚;;甲型H1N1流感病毒核酸荧光定量RT-PCR检测技术[A];中国畜牧兽医学会2009学术年会论文集（下册）[C];2009年

2 何卓晶;汪一帆;郭潮潭;;A型流感病毒受体识别及种间传播的研究进展[A];2007年浙江省医学病毒学、医学微生物与免疫学学术年会论文汇编[C];2007年

3 唐应华;张评浒;薛峰;刘晓文;刘秀梵;;禽流感H9亚型血凝素单克隆抗体的研制和初步应用[A];第六届全国会员代表大学暨第11次学术研讨会论文集（下）[C];2005年

4 刘叔文;李润明;张瑞涛;朱志博;郑伯建;;CL-385319作用于H5型血凝素蛋白抑制H5N1禽流感病毒的感染[A];第十届全国抗炎免疫药理学学术会议论文集[C];2010年

5 王传彬;孙明;田克恭;王宏伟;遇秀玲;陈西钊;;H_7N_2禽流感病毒分离株研究:Ⅲ.两株H_7N_2禽流感病毒血凝素蛋白全基因序列分析[A];第六届全国会员代表大学暨第11次学术研讨会论文集（下）[C];2005年

6 南文龙;金宁一;鲁会军;赵翠青;田明尧;张金双;谭磊;田宇飞;;H3/H1流感血凝素真核表达质粒构建及在HeLa细胞中的表达[A];中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第七届全国会员代表大会暨第十三次学术研讨会论文集（下册）[C];2009年

7 张继荣;姚青;;2007～2011年H9N2亚型禽流感病毒血凝素分子进化分析[A];中国畜牧兽医学会兽医公共卫生学分会第三次学术研讨会论文集[C];2012年

8 黄欣梅;李银;;4株H9亚型禽流感病毒血凝素全基因的克隆与序列分析[A];中国畜牧兽医学会禽病学分会第十五次学术研讨会论文集[C];2010年

9 李建伟;崔尚金;孟庆文;于康震;金红;唐秀英;田国斌;刘宝全;;禽流感病毒H9N2亚型分离株的全病毒基因序列分析[A];中国生物工程学会第三次全国会员代表大会暨学术讨论会论文摘要集[C];2001年

10 赵静;张秀美;王莉莉;艾武;黄兵;井庆川;;乌鸡新城疫病毒的分离与鉴定[A];山东免疫学会、山东微生物学会医学微生物学专业委员会、山东省医学会微生物学和免疫学专业委员会、山东省医药生物技术学会2001年学术年会论文汇编[C];2001年

相关重要报纸文章 前10条

1 云文;初见端倪的免疫食物[N];山西经济日报;2000年

2 本报驻美国记者 毛黎;警惕甲型H1N1流感病毒变异[N];科技日报;2009年

3 李点;杀死袭击人体的叛逆细胞[N];北京科技报;2001年

4 记者 谭嘉;京首株甲型H1N1流感病毒无较大变异[N];健康报;2009年

5 记者 张新生;巴发现新型流感病毒出现变异[N];科技日报;2009年

6 记者 李天舒;甲流病毒重要蛋白研究获突破[N];健康报;2010年

7 中国疾病预防控制中心应急办副主任 余宏杰;禽流感病毒不怕冷[N];健康报;2008年

8 本报记者 袁志勇;甲型H1N1病毒 万变不离其宗？[N];科技日报;2009年

9 本报记者 孟庆普;“甲流”病毒基因位点突变不等于病毒变异[N];健康报;2009年

10 记者 曾繁娟;H1N1流感病毒飞沫传播有条件[N];新华每日电讯;2011年

相关博士学位论文 前10条

1 张卫东;甲（A）型流感病毒多基因表达DNA疫苗的构建及其免疫效果研究[D];四川大学;2006年

2 谌资;H5N1血凝素蛋白的重组牛痘病毒表达纯化以及耐奥司他韦神经氨酸酶动力学研究[D];中南大学;2009年

3 高玉伟;虎源和狮源H5N1亚型流感病毒进化分析与HA基因重组犬2型腺病毒构建研究[D];吉林大学;2006年

4 程坚;表达和共表达H9亚型禽流感病毒血凝素基因和鸡Ⅱ型干扰素基因的重组鸡痘病毒[D];扬州大学;2001年

5 John M.Dikki;减毒沙门氏菌为载体的原核与真核表达和鸡新城疫病毒表面糖蛋白基因免疫研究[D];浙江大学;2005年

6 孔冬妮;H5亚型禽流感病毒HA基因突变对其细胞融合胰酶依赖性的影响及尼帕脑炎重组新城疫病毒活载体疫苗的研究[D];中国农业科学院;2012年

7 王伟利;不同源性禽流感病毒株的分离鉴定及其主要基因信息的研究[D];吉林农业大学;2006年

8 陈闻天;N-糖基化位点在流感病毒（H5N1）中的协同进化及对宿主特异性影响[D];西北大学;2012年

9 丁壮;新城疫病毒HN蛋白基因的克隆、序列分析、表达及其免疫原性研究[D];中国人民解放军军需大学;2001年

10 李传友;结核分枝杆菌黏附素HBHA的制备及其应用研究[D];北京市结核病胸部肿瘤研究所;2005年

相关硕士学位论文 前10条

1 田兴华;新城疫病毒B_（95）株血凝素—神经氨酸酶基因的克隆与表达[D];河北农业大学;2002年

2 杨文;A、B型流感病毒血凝素基因抗流感关键序列解析[D];湖南师范大学;2004年

3 张玉松;H5N1禽流感病毒HA假病毒的构建及特性研究[D];中国疾病预防控制中心;2008年

4 徐忠林;共表达NDV F 基因与H9亚型AIV HA基因的重组鸡痘病毒及其免疫效力[D];扬州大学;2005年

5 蔡先全;B型流感病毒核酸疫苗和CpG基序免疫增强作用研究[D];湖南师范大学;2005年

6 邱美珍;禽流感核酸疫苗免疫保护性研究[D];湖南师范大学;2005年

7 曹康;流感病毒血凝素HA1基因克隆及其真核表达[D];四川大学;2005年

8 嵇康;A型流感病毒HA基因遗传多样性与2007-2008年中国部分地区H9亚型禽流感病毒HA基因分子进化分析[D];东北农业大学;2009年

9 李淑云;H5N1禽流感病毒血凝素蛋白的表位预测及重组表达[D];华中农业大学;2009年

10 王鼎;甲型流感病毒表面血凝素（HA）与神经氨酸酶（NA）之间的相互作用[D];暨南大学;2011年

，

本文编号：1880766