4种血清型登革病毒NS1蛋白序列及B细胞抗原表位特异性分析

发布时间：2018-10-23 11:41

【摘要】：目的比较4种血清型登革病毒NS1蛋白型特异性抗原表位基因序列及氨基酸序列之间的差异,为利用基因差异进行血清学分型及疫苗研究提供新的线索。方法利用DNAstar数据包中的Editseq程序,从20株登革病毒分离株的全基因组序列中将NS1基因型特异性抗原表位序列截取出来,再用ClustalX软件进行多序列比对,进行同源性分析,找出型内最为保守的抗原表位序列。并将比对结果在120株登革病毒序列中进一步验证。结果 NS1蛋白36～45和71～85位氨基酸为型特异性抗原表位,高度保守,型内完全相同,型间不同。结论 NS1蛋白36～45位氨基酸可以作为登革病毒血清分型和研制亚单位疫苗的靶标。
[Abstract]:Objective to compare the sequences of epitopes and amino acids of NS1 protein epitopes of four serotypes of dengue virus in order to provide a new clue for serological typing and vaccine research. Methods using the Editseq program in the DNAstar packet, the NS1 genotypic epitope sequences were intercepted from the genome sequences of 20 dengue virus isolates, and then the multiple sequence alignment was performed with ClustalX software for homology analysis. Identify the most conserved epitopes in the type. The results were further verified in 120 strains of dengue virus. Results the amino acids at the NS1 protein 365and 71C 85 were type-specific epitopes, highly conserved, identical in type and different in type. Conclusion Amino acid of NS1 at 36C / 45 can be used as a target for dengue virus serotyping and subunit vaccine development.
【作者单位】： 南方医科大学公共卫生与热带医学学院中心实验室;
【基金】：国家自然科学基金资助项目(U1132002) 广州市科技计划项目(2008Z1E4011) 新发传染病防治广东普通高校重点实验室基金(KLB09007)
【分类号】：R373.33

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本文编号：2289127