肺炎克雷伯菌全基因组DNA芯片的研制和质量评价

发布时间：2019-11-14 06:18

【摘要】：目的研制肺炎克雷伯菌(KP)全基因组DNA芯片并对芯片质量进行评价。方法根据KP的NTUH-K2044全基因组序列,挑选出5075条基因,PCR扩增各基因并纯化产物,点样制备芯片。设计了3个质控杂交组合,采用双色荧光杂交策略,对芯片质量进行评价。结果与结论芯片杂交结果与理论预期结果一致。本研究成功研制了KP全基因组DNA芯片,并建立了基于全基因组DNA芯片的KP比较基因组学技术平台。

【参考文献】

相关期刊论文 前2条

1 周冬生,韩延平,戴二黑,宋亚军,包静月,裴德翠,李敏,崔百忠,张秀清,童宗中,王津,郭兆彪,祁芝珍,金丽霞,翟俊辉,杜宗敏,王效义,汪建,黄培堂,杨瑞馥;鼠疫耶尔森菌全基因组DNA芯片的研制及用于比较基因组学分析[J];解放军医学杂志;2004年03期

2 韩海红;曾小涛;殷胜骏;杨瑞馥;刘秀梅;周冬生;;副溶血性弧菌全基因组DNA芯片的研制和质量评价[J];微生物学报;2010年04期

【共引文献】

相关期刊论文 前10条

1 周冬生,韩延平,宋亚军,童宗中,裴德翠,戴二黑,张玲,包静月,李敏,崔百忠,张秀清,王津,郭兆彪,祁芝珍,金丽霞,翟俊辉,杜宗敏,王效义,汪建,黄培堂,杨瑞馥;鼠疫耶尔森菌基因组进化与生态位适应研究[J];解放军医学杂志;2004年03期

2 韩延平,周冬生,宋亚军,裴德翠,李敏,崔百忠,包静月,张秀清,童宗中,王津,郭兆彪,祁芝珍,金丽霞,翟俊辉,杜宗敏,王效义,汪建,黄培堂,杨瑞馥;鼠疫耶尔森菌DNA标识序列的鉴定及其应用研究[J];解放军医学杂志;2004年04期

3 周冬生,韩延平,戴二黑,王津,宋亚军,童宗中,裴德翠,张玲,包静月,李敏,崔百忠,张秀清,郭兆彪,祁芝珍,金丽霞,翟俊辉,杜宗敏,王效义,汪建,黄培堂,杨瑞馥;鼠疫耶尔森菌活疫苗株的比较基因组学研究[J];解放军医学杂志;2004年04期

4 周树武;杨进业;;鼠疫耶尔森氏菌基因分型的研究进展[J];中国热带医学;2007年03期

5 生秀梅;黄新祥;茅凌翔;朱超望;徐顺高;张海方;许化溪;刘秀梅;;伤寒沙门菌基因组DNA芯片的制备与基因表达谱分析应用[J];生物化学与生物物理进展;2009年02期

6 曾小涛;袁媛;郑玉玲;周冬生;姜永强;陈福生;;猪链球菌2型全基因组DNA芯片的研制及基因表达谱技术平台的建立[J];生物技术通讯;2009年05期

7 马立芝;高鹤;张义全;谭亚芳;郭兆彪;杨瑞馥;周冬生;;不同生长时期鼠疫耶尔森菌调控子Fis转录谱的比较分析[J];生物技术通讯;2011年02期

8 韩海红;曾小涛;殷胜骏;杨瑞馥;刘秀梅;周冬生;;副溶血性弧菌全基因组DNA芯片的研制和质量评价[J];微生物学报;2010年04期

9 李敏;戴二黑;戴瑞霞;周冬生;杨晓艳;崔百忠;金丽霞;赵海红;李存香;祁美英;次仁顿珠;戴翔;唐永娇;杨瑞馥;;青藏高原鼠疫耶尔森菌基因型分布[J];中华流行病学杂志;2006年05期

10 戴二黑,童宗中,王效义,周冬生,张建国,李蓓,杨俊兴,陈泽良,宋亚军,郭兆彪,王津,杨瑞馥;应用抑制削减杂交技术进行鼠疫耶尔森菌的比较基因组研究[J];中华微生物学和免疫学杂志;2005年03期

相关博士学位论文 前1条

1 江凌晓;应用蛋白质芯片技术分析鼠疫耶尔森菌致病相关蛋白抗体表达谱的实验研究[D];第一军医大学;2004年

相关硕士学位论文 前2条

1 赵明君;海洋弧菌复苏促进因子家族糖蛋白酶的研究[D];中国海洋大学;2011年

2 韩海红;副溶血性弧菌全基因组DNA芯片和比较基因组学研究[D];中国疾病预防控制中心;2009年

【二级参考文献】

相关期刊论文 前2条

1 刘振才,海荣,李富忠,李超,丛显斌,高崇华,汪立茂,魏柏青,陈洪舰,陈虹,于晓涛,李存香,石映祥,许光荣,李光清,吴国康,严冬丽,李敏,曹淑兰,张春华,魏建春,蔡虹;青藏高原青海田鼠鼠疫自然疫源地的发现与研究[J];中国地方病防治杂志;2001年06期

2 周冬生,韩延平,戴二黑,宋亚军,包静月,裴德翠,李敏,崔百忠,张秀清,童宗中,王津,郭兆彪,祁芝珍,金丽霞,翟俊辉,杜宗敏,王效义,汪建,黄培堂,杨瑞馥;鼠疫耶尔森菌全基因组DNA芯片的研制及用于比较基因组学分析[J];解放军医学杂志;2004年03期

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 刘万清,贺林;DNA芯片──遗传病相关基因定位中的新武器[J];国外医学.遗传学分册;1997年06期

2 郭葆玉;DNA芯片——逆向点杂交技术[J];第二军医大学学报;2000年08期

3 侯化,扬光彩;基因芯片技术在临床应用的进展[J];陕西医学检验;2000年02期

4 彭翼飞;丙型肝炎病毒基因分型研究进展[J];国外医学.分子生物学分册;2000年05期

5 靳睿,高建华,鲁峰;DNA芯片技术及其临床应用[J];疑难病杂志;2002年04期

6 张建中;临床分子生物学的研究现状和发展方向[J];总装备部医学学报;1999年04期

7 王曙,和桂芬,陈沁,吴超群,李瑶,刘建平,谢毅,毛裕民;PMA激活内皮细胞早期应答基因谱分析[J];复旦学报(自然科学版);2000年06期

8 李卫党;DNA芯片技术及其在医学研究中的应用[J];微生物学免疫学进展;2001年03期

9 唐爱发;张振明;余州;张晓燕;孙亮;叶炯贤;桂耀庭;蔡志明;;Tesmin基因在小鼠睾丸中的表达分析[J];中国男科学杂志;2009年12期

10 孙承龙,王跃国,王惠民,张冬雷,马达,赵建龙,吴月平;基因芯片检测HBV DNA聚合酶区基因多态性[J];交通医学;2003年06期

相关会议论文 前10条

1 何平;盛跃颖;史耀舟;蒋秀高;秦金红;张志明;杨杨;赵国屏;郭晓奎;;问号钩端螺旋体的比较基因组学研究[A];2006中国微生物学会第九次全国会员代表大会暨学术年会论文摘要集[C];2006年

2 何平;盛跃颖;史耀舟;蒋秀高;秦金红;张志明;杨杨;赵国屏;郭晓奎;;问号钩端螺旋体的比较基因组学研究[A];上海市预防医学会第二届学术年会论文汇编[C];2006年

3 王燕;张定东;罗俊峰;陆祖宏;;应用双色荧光检测靶分子微阵列的甲基化检测[A];中国生物医学工程进展——2007中国生物医学工程联合学术年会论文集（下册）[C];2007年

4 杨裕华;李震;;“劳倦过度、房室不节”肾阳虚鼠模型脑基因芯片研究[A];节能环保 和谐发展——2007中国科协年会论文集（二）[C];2007年

5 魏永伟;于涟;;双节段dsRNA病毒的比较基因组学研究[A];浙江省免疫学会第六次学术研讨会论文汇编[C];2007年

6 郭晓奎;;钩体基因组研究进展[A];2006中国微生物学会第九次全国会员代表大会暨学术年会论文摘要集[C];2006年

7 宋亚军;;鼠疫耶尔森氏菌比较与进化基因组学研究[A];2006中国微生物学会第九次全国会员代表大会暨学术年会论文摘要集[C];2006年

8 赵全菊;谢建平;;结核分枝杆菌蛋白酶毒力因子的分子遗传研究[A];遗传学与社会可持续发展——2010中国青年遗传学家论坛论文摘要汇编[C];2010年

9 周秀娟;但现龙;史贤明;;沙门氏菌属特异检测靶点的筛选及评价[A];中国食品科学技术学会第八届年会暨第六届东西方食品业高层论坛论文摘要集[C];2011年

10 李凌;马文丽;朱利娜;吴清华;郭秋野;郑文岭;;应用限制性显示技术制备HIV基因片段的研究[A];中国生物工程学会第三次全国会员代表大会暨学术讨论会论文摘要集[C];2001年

相关重要报纸文章 前8条

1 继成;癌症诊疗面临突破[N];医药经济报;2001年

2 记者衣晓峰 通讯员陈英云 乔蕤琳;伤寒病致病菌进化方式被揭示[N];健康报;2009年

3 宁波大学医学院 张咸宁 复旦大学医学院 左O;基因组医学对现代医学的影响[N];健康报;2000年

4 陈英云　乔蕤琳 记者 初霞 姜雪松;哈埠专家破解伤寒病致病菌进化方式[N];哈尔滨日报;2009年

5 衣晓峰　陈英云 乔蕤琳;哈医大发现伤寒病致病细菌进化方式[N];中国医药报;2009年

6 程书权;生物芯片技术在临床诊断中的应用[N];中国医药报;2003年

7 哈尔滨医科大学药学院院长 刘树林　整理 衣晓峰 乔蕤琳 包红霞;细菌何时要变异 “遗传开关”说了算[N];健康报;2011年

8 程书权;生物芯片技术——开创临床诊断新天地[N];医药经济报;2002年

相关博士学位论文 前10条

1 周冬生;鼠疫耶尔森氏菌比较和进化基因组学研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2004年

2 王效义;鼠疫耶尔森氏菌与假结核耶尔森氏菌比较基因组学研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2005年

3 倪斌;鼠疫耶尔森菌质粒缺失株的构建及其致病相关的研究[D];西北农林科技大学;2008年

4 韩延平;环境因素调控鼠疫耶尔森氏菌基因表达的比较转录谱学研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2005年

5 庞昕;鼠疫耶尔森氏菌基因表达谱技术平台的建立与应用[D];中国人民解放军军事医学科学院;2004年

6 汪莉;耶尔森氏菌91001株基因组测序、比较基因组学及Ⅲ型分泌系统研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2005年

7 戴二黑;鼠疫耶尔森氏菌基因分型与适应性微进化研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2005年

8 魏武;重要病原微生物比较基因组研究的生物信息学方法和应用[D];中国科学院研究生院（上海生命科学研究院）;2007年

9 李红丽;周期素依赖性蛋白激酶5对神经干细胞分化及脑发育作用的研究[D];第三军医大学;2003年

10 刘翠华;人粘膜病原微生物的分子致病机理及分子诊断学研究[D];第一军医大学;2005年

相关硕士学位论文 前10条

1 韩海红;副溶血性弧菌全基因组DNA芯片和比较基因组学研究[D];中国疾病预防控制中心;2009年

2 邱磊;胸腺素α原的生物学活性及DNA芯片分析研究[D];第二军医大学;2001年

3 何湘;炭疽杆菌A16与A16R比较基因组学研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2004年

4 文继开;同步检测HBV，HCV及HIV-1的DNA芯片研究[D];中国科学院研究生院（武汉病毒研究所）;2002年

5 胡章雪;β-地中海贫血与先天性软骨发育不全诊断性基因芯片的构建[D];第三军医大学;2004年

6 申小娜;鼠疫耶尔森菌编码序列及田鼠型鼠疫菌致病相关基因研究[D];中国疾病预防控制中心;2009年

7 危敏;应用DNA芯片技术研究细胞松弛素B诱导K562细胞脱核的分子机制[D];中国人民解放军第一军医大学;2003年

8 马晓冬;制备炭疽芽胞杆菌检测基因芯片的初步研究[D];第一军医大学;2004年

9 张翼冠;基于膜显色结果判读的HCV基因分型检测芯片平台构建[D];郑州大学;2004年

10 刘倩;基于转录终点信号或保守性的大肠杆菌sRNA预测研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2011年

，

本文编号：2560686