中间链球菌的基因组学研究与无形体及汉坦病毒的分子流行病学研究

发布时间：2020-06-18 17:55

【摘要】：背景中间链球菌(Streptococcus intermedius)是一种兼性厌氧性、嗜微氧性、革兰氏阳性和β-溶血性微生物,通常栖息于口腔、咽喉和胃肠道菌群中。它与星座链球菌和咽峡链球菌一起属于咽峡链球菌菌群(Streptococcus anginosus group,SAG)。它们的特征都是分泌蛋白水解酶,破坏组织,促进脓肿形成。当机体免疫力降低时,该菌群感染的机会增加。在该菌群中,中间链球菌的致病性最强,表现为低生存率和较长的住院时间。由SAG菌群引起的化脓性感染主要发生在口腔和上体区。然而,中间链球菌更容易导致严重的脑和肝脓肿,最常见的是在口腔牙齿操作之后。由中间链球菌引起的脑脓肿的发病机制与肺炎链球菌相似,对人类的健康造成严重的威胁。鼻窦炎、发绀性先天性心脏病、中耳炎、龋齿等是中间链球菌感染的危险因素。随着越来越多中间链球菌引起各个部位的脓肿病例报道的出现,让人们越来越清晰地认识到中间链球菌与机体各个系统感染的临床关系,识别鉴定该菌种对患者的及时治疗有重要意义。无形体属、埃立克体属、新立克次体属和沃尔巴克氏体属细菌属于无形体科立克次体目a-变形菌纲变形菌门细菌界。无形体属细菌种类繁多,目前包括嗜吞噬细胞无形体(Anaplasma phagocytophilum,AP)、中央无形体(Anaplasma centrale)、边缘无形体(Anaplasma marginale)、绵羊无形体(Anaplasma ovil)、牛无形体(Anaplasma boivs)、山羊无形体(Anaplasma capra)、血小板无形体(Anaplasma platys)和尾状无形体(Anaplasma caudatum)等。无形体病(anaplasmosis)是无形体属的各种细菌成员引起的威胁人类健康的急性发热性经蜱传播的人畜共患自然疫源性疾病。嗜吞噬细胞无形体、山羊无形体、绵羊无形体可感染人类,对人类造成严重的疾病。而中央无形体、边缘无形体、绵羊无形体、牛无形体和血小板无形体可以感染羊、牛、鹿和狗等哺乳类动物。无形体需要依赖于在宿主动物体内的持续性感染来维持其自然循环。野生哺乳动物、许多小型兽类和家畜等都可作为病原体的携带者和传染源,并且不同地区不同种类的病原体具有不同的优势宿主。蜱虫是无形体最重要的传播媒介。无形体主要通过蜱虫叮咬的方式传播,蜱虫叮咬携带病原体的宿主动物后,将病原体经期传播至下一个阶段,如幼蜱获得病原体后可以将病原体传播至稚蜱和成蜱阶段,并在再次叮咬宿主动物时,病原体随之进入下一个宿主动物引起疾病。目前已有大量的文献报道在不同地区不同蜱种内检测到无形体核酸序列。由于生态环境的变化,蜱的分布范围越来越广泛,人的生活环境和宿主动物的生态的改变使人类与蜱的接触越来越多,关系也越密切,而且由于病原体的不断变异和进化,促使新发蜱媒传染病的增加和新的人畜共患病的发生,因此了解此类疾病的传播媒介和宿主的流行病学特征,对于做好新发传染病的预防和控制具有重要的作用。汉坦病毒(Hantavirus,HV)主要引起两种疾病:肾综合征出血热(Hemorrhagic fever with renal syndrome,HFRS)和汉坦病毒肺综合征(Hantavirus pulmonary syndrome,HPS)。HV的主要宿主是啮齿类和食虫目动物,可造成宿主终生携带病毒的持续性隐性感染状态。人类吸入带病毒的宿主动物的排泄物,如尿液、粪便、唾液等的气溶胶,或者食入被感染的食物和被携带病毒的宿主动物抓咬造成伤口等的接触感染。HV具有宿主特异性,并且与其宿主动物共进化,如鼠亚科相关的汉滩病毒(HTNV)、汉城病毒(SEOV)、多布拉伐病毒(DOBV),田鼠亚科相关的普马拉病毒(PUUV)、希望山病毒(PHV),主要分布于欧洲和亚洲,可引起HFRS。棉鼠亚科相关的辛诺柏病毒(SNV)和安第斯病毒(ANDV),主要分布于美洲,可引起HPS。食虫动物相关的汉坦病毒分布广泛,其致病性尚未知,如索托帕拉雅病毒(TPMV)。HFRS在世界范围内不断发生,成为一个严重的世界性的公共卫生问题。我国是世界上HFRS发病率最高的国家,每年新报道病例数占全球新报道病例数的九成以上,迄今为止我国累计发病人数超过100万,平均发病率估计在3.5/10万左右,流行期间可造成30%的感染者死亡,该病在我国分布广泛且疫区类型复杂,成为我国重点防治的传染病之一。目的1.运用基因组学的方法分析中间链球菌的基因组特征、毒力因子、泛基因组特征等,揭示其致病机制及遗传多样性,为临床诊断和治疗提供理论依据以及引起医务工作者对中间链球菌感染的重视及预防医院内感染。2.通过检测、分析自然状态下传播媒介蜱类携带无形体的感染状况,以及对蜱中是否携带新型无形体进行筛查,为无形体病的预防控制提供理论基础以及引起卫生工作者和普通人对新型致病菌的重视。3.通过检测食虫目

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