福尔马林固定石蜡包埋组织切片蛋白质组分析方法与应用研究进展

发布时间：2020-11-10 01:16

　　 福尔马林固定石蜡包埋(Formalin-fixed and paraffin-embedding,FFPE)是最常见的临床组织保存技术,FFPE组织具有标准化的制备流程、易于存储、标本量大、包含较完整的临床回顾性信息等特点,而成为疾病生物标志物发掘的良好载体。近年来,基于临床FFPE组织的特点,发展了系列蛋白质组学研究方法,包括样本制备、消解、分离到蛋白质质谱鉴定等多个领域,总体呈现出微量、高灵敏度、高通量的技术特点,并已成功用于肿瘤精准医学等临床蛋白质组研究。该综述将对FFPE组织切片样本的蛋白质组学方法,以及其在肿瘤研究中的应用进行概述,从而为临床精准医学蛋白质组学的研究提供借鉴思路。
【部分图文】：

2 FFPE组织切片样本制备过程中的化学修饰在组织固定过程中,甲醛可与多种蛋白质氨基酸残基发生反应或交联[1,4]。Metz等[4]基于质谱技术,发现了蛋白质与甲醛的交联规则:第一阶段,蛋白质分子上的伯胺基和甲醛的醛基之间形成胺基-羟甲基加合物(图1,反应[1]);然后分子内消除1个水分子产生席夫碱(图1,反应[2])。第二阶段,蛋白质中氨基酸(如酪氨酸)上的亲核基团进攻席夫碱的亚甲基碳产生交联(图1,反应[3])。此外,在福尔马林溶液中,甲醛可迅速水合形成亚甲基二醇,蛋白质分子中的伯胺基团可与醇羟基反应形成缩醛,或者与芳环形成羟甲基,再进一步参与交联反应[5]。
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本文编号：2877243