先天性晚发白内障FVB小鼠突变基因定位及筛选

发布时间：2020-12-29 00:44

　　目的以自发突变导致的先天性晚发白内障小鼠为模型,进行遗传方式鉴定和白内障相关基因定位分析。方法首先通过显微镜观察组织切片鉴定白内障病理状态,其次通过构建家系确定先天性晚发白内障在FVB小鼠中的遗传方式,其次利用多重PCR靶向测序进行100只F2代小鼠的全基因组SNP扫描定位,最后利用全外显子测序筛选出候选突变基因。结果组织切片表明自发突变引起为典型白内障性状,全基因组扫描定位显示11号染色体上的rs4228772 SNP位点与白内障表型连锁程度最高;全外显子测序结果进一步表明11号染色体上有三个基因产生了自发突变,分别是Sfi1,Obscn和Ptrh2。结论本研究使用全基因组SNP扫描连锁分析与外显子测序相结合的策略,可在已知参考基因组的物种中快速定位基因突变,结果确定了11号染色体上的三个突变基因为先天性晚发型白内障的候选基因,并以显性方式遗传。该策略亦可应用于其它遗传背景清晰的模式哺乳动物的基因功能研究。 

【文章来源】：中国比较医学杂志. 2020年01期 北大核心

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

各染色体上SNP位点FVB纯合子所占比例

候选SNP及Indel染色体分布图

图3中展示了这些变异位点在染色体上的分布，并结合2.2中全基因组SNP扫描的结果，标记了11号染色体上的3个候选突变基因(Sfi1,Obscn,Ptrh2)。根据基因注释结果，Ptrh2基因在86689778位置上发生C→T的无义突变(stop-gain)，使得基因在该位置提前产生终止密码子;Sfi1基因在3134337位置上发生G→A的错义突变(missense);Obscn基因在59054628位置上发生C→CA的移码突变(frameshift insertion)。图2 各染色体上SNP位点FVB纯合子所占比例


本文编号：2944670