刚地弓形虫动力蛋白轻链8a的生物信息学分析

发布时间：2021-02-06 05:00

　　目的通过生物信息学在线程序及软件分析弓形虫动力蛋白轻链8a（TgDLC8a）,预测其结构、免疫原性及抗原性。方法利用生物信息学在线软件ProtParam、SOSUI、ProtScale、TMHMM Server v.2.0、SignalP-5.0、TargetP1.1、Coils、SOPMA、NetPhos 3.1Server、SWISS-MODEL、SYFPEITHI及DNAMAN软件、DNAStar软件等分析预测TgDLC8a蛋白的理化性质、亲疏水性、跨膜结构域、信号肽、亚细胞定位、可溶性、柔韧性、表面可及性、二级结构、蛋白翻译后修饰位点、三级结构及B细胞和T细胞抗原表位。结果 TgDLC8a蛋白含有138个氨基酸,分子式为C723H1128N192O195S11,相对分子质量为15.928 74×10³,理论等电点为8.69,半衰期为30h,不稳定系数为37.09,脂溶性指数为88.33,总平均亲水性系数为0.025,属于疏水性蛋白;该蛋白有跨膜结构域,无信号肽切割位点,亚细胞定位预测可能是分泌蛋白;二级结构中α螺旋和β折叠分别占41.30%和23.91%,... 

【文章来源】：中国病原生物学杂志. 2020,15(04)北大核心

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

TgDLC8a蛋白的亲、疏水性

经TargetP 1.1程序分析，TgDLC8a蛋白包含线粒体靶向肽（mTP）序列，定位于线粒体的可能性为0.114，包含信号肽（SP），为分泌蛋白的可能性为0.843，以其他形式存在的可能性为0.068，即该蛋白属分泌型蛋白的可能性大（图4）。图3 TgDLC8a蛋白的Coils预测结果

TgDLC8a蛋白的Coils预测结果

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3020193