人CSE蛋白的结构与功能分析
发布时间：2021-03-23 04:22
胱硫醚-γ-裂合酶（Cystathionine-γ-lyase,CSE）是一种参与半胱氨酸合成并催化H2S生成的关键性限速酶,具有信号传导和细胞保护作用。分析人CSE蛋白的结构及其功能对了解其调控机制具有重要意义。利用生物信息数据库和分析软件,对人CSE蛋白进行分子结构和理化性质分析。结果显示:人CSE蛋白位于人类1号染色体,含有373个氨基酸是稳定的亲水性蛋白,不具有跨膜结构,无信号肽属于非分泌性蛋白,蛋白二级结构以无规则卷曲为主,含有保守结构域、蛋白定位于细胞质的可能性大、具有大量的丝氨酸（Ser）磷酸化位点和较少的酪氨酸（Tyr）磷酸化位点、与TST、TXNRD1等蛋白有结合能力。对CSE蛋白的分子结构与功能分析为深入研究CSE蛋白的作用机制提供了研究基础。
【文章来源】：生物信息学. 2020,18(03)
【文章页数】：8 页
【部分图文】：
人CSE蛋白磷酸化位点预测
利用SWISS-MODEL预测人CSE蛋白的三级结构,GMQE为0.97,QMEAN为-0.54,序列与BLAST数据库中5tsu.1模板序列相似性高达99.19%,表明该模型结构合理,该蛋白质存在较多扭曲,结构较丰富,这对其生物学功能具有重要作用(见图8)。2.10 人CSE蛋白互作网络分析
使用STRING预测人CSE蛋白互作网络,设置为高置信度0.7,限制数量10个。结果发现人CSE蛋白与DLD、TST、CBSL、TXNRD1等蛋白质具有相互作用(见图9)。对以上互作蛋白的基因进行GO分析和KEGG通路分析,GO分析结果表明互作基因主要参与辅因子结合、维生素结合和催化活化等分子功能(见表3)涉及硫氨基酸代谢过程、硫氨基酸生物合成、α-氨基酸生物合成、细胞氨基酸代谢等生物过程(见表4)。KEGG通路分析结果显示,互作基因显著富集于半胱氨酸与蛋氨酸代谢、甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢、氨基酸生物合成、硒化合物代谢等通路中(见表5)。表3 GO分子功能分类结果Table 3 GO molecular function results ID 分子功能注释 基因数量 / 个 错误发现率 GO:0048037 辅因子结合 7 1.39×10-7 GO:0050662 辅酶结合 6 1.41×10-7 GO:0019842 维生素结合 4 2.06×10-5 GO:0003824 催化活性 11 2.10×10-5
【参考文献】：
期刊论文
[1]内源性硫化氢对硫酸铍致大鼠肺组织急性损伤影响[J]. 廖永红,黄炼,王淑娟,胡立丹,张朝晖. 中国职业医学. 2013(05)
本文编号：3095125
【文章来源】：生物信息学. 2020,18(03)
【文章页数】：8 页
【部分图文】：
人CSE蛋白磷酸化位点预测
利用SWISS-MODEL预测人CSE蛋白的三级结构,GMQE为0.97,QMEAN为-0.54,序列与BLAST数据库中5tsu.1模板序列相似性高达99.19%,表明该模型结构合理,该蛋白质存在较多扭曲,结构较丰富,这对其生物学功能具有重要作用(见图8)。2.10 人CSE蛋白互作网络分析
使用STRING预测人CSE蛋白互作网络,设置为高置信度0.7,限制数量10个。结果发现人CSE蛋白与DLD、TST、CBSL、TXNRD1等蛋白质具有相互作用(见图9)。对以上互作蛋白的基因进行GO分析和KEGG通路分析,GO分析结果表明互作基因主要参与辅因子结合、维生素结合和催化活化等分子功能(见表3)涉及硫氨基酸代谢过程、硫氨基酸生物合成、α-氨基酸生物合成、细胞氨基酸代谢等生物过程(见表4)。KEGG通路分析结果显示,互作基因显著富集于半胱氨酸与蛋氨酸代谢、甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢、氨基酸生物合成、硒化合物代谢等通路中(见表5)。表3 GO分子功能分类结果Table 3 GO molecular function results ID 分子功能注释 基因数量 / 个 错误发现率 GO:0048037 辅因子结合 7 1.39×10-7 GO:0050662 辅酶结合 6 1.41×10-7 GO:0019842 维生素结合 4 2.06×10-5 GO:0003824 催化活性 11 2.10×10-5
【参考文献】：
期刊论文
[1]内源性硫化氢对硫酸铍致大鼠肺组织急性损伤影响[J]. 廖永红,黄炼,王淑娟,胡立丹,张朝晖. 中国职业医学. 2013(05)
本文编号：3095125
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