Zkscan3的结构与功能分析
发布时间：2021-04-09 15:50
锌指蛋白是一类含有锌指结构的蛋白,其中锌指结构通过锌离子与周围的氨基酸残基基团非共价交联,形成稳定的DNA结合结构域。锌指结构发现后的十余年间,陆续有10多类这样的结构被发现。其中,包含最初发现的TFIIIA型锌指结构域的蛋白总数达到人类基因产物的1%左右。通常根据锌指蛋白的结构序列特征与功能,可将其分为9大类,分别为Cys2His2,Cys8,Cys6,Cys3His Cys4,Cys2His Cys,Cys2His Cys5,Cys4,Cys3His,Cys4His Cys3。根据锌指蛋白中围绕锌离子的残基的空间结构,又可将其分为C2H2样锌指、高音谱号锌指、带状锌指、塞结状锌指、类Zn2/Cys6锌指、类TAZ2锌指、锌结合短环锌指与金属硫蛋白锌指,其中前3个组群包含了大多数锌指。自锌指结构首次发现于非洲爪蟾卵母细胞以来,数千种锌指蛋白相继被鉴定出来。结构的多样赋予其强大的功能,在转录及转录后调控,蛋白折叠与装配以及DNA、RNA识别等分子功能基础上,参与调节胚胎发育、机体免疫及肿瘤形成、发展等过程。锌指蛋白作为分布最为广泛的转录因子,在调节生物体功能的过程中扮演着重要角色。ZK...
【文章来源】：苏州大学江苏省
【文章页数】：89 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
中Zif268与DNA的作用方式
一、引言 Zkscan3的结构与功能分析胞分裂的过程中也将永久存在，在胚胎生成早期 TEs 的甲基化被认为将永远沉默，不再需要相关的 KRAB-ZFPs 抑制因子的持续表达[31]。Zkscan3 作为 KRAB-ZFPs 的其中一个成员，在肿瘤的发生、发展过程中发挥重要的促进作用，并且发现其在自噬过程中也发挥了调节作用，但是对于此基因在正常生理条件下所发挥的作用依然未知，为了加深对 Zkscan3 生理功能的了解，我们此前构建了该基因的敲除小鼠模型如图 1-2 中 A 所示。将 Zkscan3 基因的第二外显子进行敲除，得到基因敲除小鼠，对出生后小鼠的基因型进行统计发现，各基因型小鼠的出生率与孟德尔分离定律相符，说明在小鼠胚胎发育阶段，基因的敲除并未对小鼠发育产生显著的影响。对出生后小鼠的体重进行监测发现，随着小鼠的生长，其体重在不同基因型之间并无显著差异，说明基因的敲除对小鼠的正常生长并没有明显的抑制作用。
图 1-3. 野生与 Zkscan3 基因敲除小鼠主要器官 H&E染色结果图。对不同基因小鼠的肾、肝、肺与胸腺进行石蜡切片并 H&E 染色，分别在 5倍与 20 倍物镜下观察组织的结构与病理变化。随后对野生型小鼠与敲除型小鼠体内的 mRNA 进行克隆分析，然而经测序发现，基因敲除小鼠体内仍有截短型 Zkscan3 mRNA 的表达如图 1-4 中 A 所示。将此 RNA 序列与 GFP 进行融合表达，结果发现虽然该转录本缺失了第二外显子部分，但是仍然可以正常转录，并与 GFP 形成融合蛋白表达于细胞中，如图 1-4 中C 所示。
【参考文献】：
期刊论文
[1]Zinc finger protein 139 expression in gastric cancer and its clinical significance[J]. Yong Li,Qun Zhao,Li-Qiao Fan,Li-Li Wang,Bi-Bo Tan,Yan-Li Leng,Yu Liu,Dong Wang. World Journal of Gastroenterology. 2014(48)
本文编号：3127896
【文章来源】：苏州大学江苏省
【文章页数】：89 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
中Zif268与DNA的作用方式
一、引言 Zkscan3的结构与功能分析胞分裂的过程中也将永久存在，在胚胎生成早期 TEs 的甲基化被认为将永远沉默，不再需要相关的 KRAB-ZFPs 抑制因子的持续表达[31]。Zkscan3 作为 KRAB-ZFPs 的其中一个成员，在肿瘤的发生、发展过程中发挥重要的促进作用，并且发现其在自噬过程中也发挥了调节作用，但是对于此基因在正常生理条件下所发挥的作用依然未知，为了加深对 Zkscan3 生理功能的了解，我们此前构建了该基因的敲除小鼠模型如图 1-2 中 A 所示。将 Zkscan3 基因的第二外显子进行敲除，得到基因敲除小鼠，对出生后小鼠的基因型进行统计发现，各基因型小鼠的出生率与孟德尔分离定律相符，说明在小鼠胚胎发育阶段，基因的敲除并未对小鼠发育产生显著的影响。对出生后小鼠的体重进行监测发现，随着小鼠的生长，其体重在不同基因型之间并无显著差异，说明基因的敲除对小鼠的正常生长并没有明显的抑制作用。
图 1-3. 野生与 Zkscan3 基因敲除小鼠主要器官 H&E染色结果图。对不同基因小鼠的肾、肝、肺与胸腺进行石蜡切片并 H&E 染色，分别在 5倍与 20 倍物镜下观察组织的结构与病理变化。随后对野生型小鼠与敲除型小鼠体内的 mRNA 进行克隆分析，然而经测序发现，基因敲除小鼠体内仍有截短型 Zkscan3 mRNA 的表达如图 1-4 中 A 所示。将此 RNA 序列与 GFP 进行融合表达，结果发现虽然该转录本缺失了第二外显子部分，但是仍然可以正常转录，并与 GFP 形成融合蛋白表达于细胞中，如图 1-4 中C 所示。
【参考文献】：
期刊论文
[1]Zinc finger protein 139 expression in gastric cancer and its clinical significance[J]. Yong Li,Qun Zhao,Li-Qiao Fan,Li-Li Wang,Bi-Bo Tan,Yan-Li Leng,Yu Liu,Dong Wang. World Journal of Gastroenterology. 2014(48)
本文编号：3127896
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