实验用猫SNP位点和微卫星标记遗传检测方法的建立及初步应用

发布时间：2021-06-09 19:01

　　虽然早在19世纪末猫就作为实验用动物用于生物医学研究,制药业等研究领域,但关于检测实验用猫遗传质量的研究鲜有报道。建立相应的遗传检测方法,制定相关的地方标准,对于确保实验用猫的质量和实验数据准确性至关重要。但我国目前尚未出台检测实验用猫遗传质量的国家标准,各地方也没有成熟的实验用猫遗传质量地方标准。随着国内大专院校,药品生产企业以及检定机构对实验用猫使用量的增加,建立符合我国目前研究水平和应用要求的实验用猫遗传质量标准和遗传质量检测方法迫在眉睫。本研究建立了两种用于实验用猫的遗传质量检测方法:第一种是建立实验用猫STR遗传质量检测方法。通过检索GeneBank数据库以及参考相关文献,备选了74个微卫星位点。以琼脂糖凝胶电泳和STR扫描结果为依据逐步筛选扩增效果好且多态性高的微卫星位点,共得到41个微卫星位点。进而考虑到这些位点在染色体的分布情况,在猫的常染色体（除了A1、B1染色体）上适当选择了1²个多态性位点。最终筛选出31个STR位点用于检测,并初步分析了三种实验用猫群体（暹罗猫、家猫、虎皮猫）的遗传结构。结果表明,暹罗猫、家猫和虎皮猫的平均杂合度分别为0.6... 

【文章来源】：中国食品药品检定研究院北京市

【文章页数】：105 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

FCA221位点PCR产物的琼脂糖凝胶电泳图谱

筛选时5个SNP位点的HRM分型结果

在rs784562870的直接测序结果以及BLAST/BLAT分析比对情况

【参考文献】：
期刊论文
[1]用45个SNP位点组合对国家啮齿类实验动物种子中心3个封闭群小鼠群体的遗传状况分析[J]. 李银银,王洪,李长龙,郭萌,魏杰,张钰,黄韧,陈振文,杜小燕.  实验动物科学. 2018(01)
[2]豚鼠个体及品系间多态性微卫星位点筛选[J]. 卫振,洪胜辉,刘迪文.  中国比较医学杂志. 2017(11)
[3]实验用猫研究现状和发展趋势探讨[J]. 方远书,何忠平,裘颖儿.  山东畜牧兽医. 2017(10)
[4]巴马小型猪和贵州小型猪封闭群的遗传结构分析[J]. 王思珍,郭闯,郭猛,贺宽军,曹颖霞,杜小燕,陈振文.  中国兽医学报. 2017(07)
[5]猫实验动物标准化的研究进展及探讨[J]. 刘明慧,袁宝,陈健,高巍,胡进平,俞先峰,刘殿峰,任文陟.  吉林畜牧兽医. 2015(02)
[6]非损伤采样提取DNA技术在猫科动物调查中的应用[J]. 周许伟,宋景良,王福有,夏文军,乌力吉,张震寰,鲍伟东.  兽类学报. 2015(01)
[7]三种血液基因组DNA提取方法的比较研究[J]. 李芳芳,魏杰,王洪,岳秉飞.  实验动物科学. 2014(05)
[8]房山封闭群小型猪微卫星位点的测定[J]. 魏杰,王吉星,王洪,李芳芳,岳秉飞.  中国比较医学杂志. 2013(11)
[9]应用微卫星标DNA记对三个封闭群兔遗传分析[J]. 申幸娇,岳秉飞.  中国比较医学杂志. 2013(09)
[10]云南红骨圭山山羊微卫星DNA位点遗传多样性分析[J]. 樊月圆,余淑青,曹振辉,荣华,廖国周,谷大海,林秋叶,殷红,徐志强,史宪伟,张曦,高士争,葛长荣,贾俊静.  云南农业大学学报(自然科学). 2013(03)

硕士论文
[1]滇西亚种树鼩微卫星筛选及群体多态性分析[D]. 张媛.北京协和医学院 2015
[2]猫微卫星DNA标记遗传检测方法的建立及对虎皮猫群体遗传结构的分析[D]. 衣帅.吉林大学 2013
[3]大鼠SNP遗传检测技术研究[D]. 王淑菁.中国药品生物制品检定所 2011



本文编号：3221141